22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_02500 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_02500  Protein of unknown function (DUF2516)  100 
 
 		 99 aa  195  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6772  hypothetical protein  52.88 
 
 		 107 aa  110  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25648  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0842  hypothetical protein  47.96 
 
 		 100 aa  78.6  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10484  transmembrane protein  52.05 
 
 		 87 aa  69.3  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.363329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0775  hypothetical protein  47.06 
 
 		 104 aa  66.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0809  hypothetical protein  45.05 
 
 		 93 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.834583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0099  hypothetical protein  43.68 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0513827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0845  cyclic nucleotide-binding  39.02 
 
 		 116 aa  57  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.846806 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4620  hypothetical protein  34.78 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4330  Protein of unknown function DUF2516  41.56 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0381  hypothetical protein  40.26 
 
 		 105 aa  52.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0467572 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0318  hypothetical protein  37.23 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0637  hypothetical protein  46.48 
 
 		 94 aa  52  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.102221  normal  0.0409068 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0657  hypothetical protein  46.48 
 
 		 94 aa  52  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0721883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0644  hypothetical protein  46.48 
 
 		 94 aa  52  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.175104  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8229  hypothetical protein  40.7 
 
 		 108 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3657  hypothetical protein  43.24 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.199937  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0486  hypothetical protein  39.51 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.526318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4187  hypothetical protein  36.47 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0946  hypothetical protein  36.36 
 
 		 108 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.615167  normal  0.605499 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2918  hypothetical protein  34.15 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0719  hypothetical protein  35.8 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.918882  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>