15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3657 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3657  hypothetical protein  100 
 
 		 99 aa  202  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.199937  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0842  hypothetical protein  39.13 
 
 		 100 aa  51.2  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4330  Protein of unknown function DUF2516  44.44 
 
 		 99 aa  51.2  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2918  hypothetical protein  38.89 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02500  Protein of unknown function (DUF2516)  43.24 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6772  hypothetical protein  38.2 
 
 		 107 aa  45.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25648  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0665  hypothetical protein  35.8 
 
 		 108 aa  44.7  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10484  transmembrane protein  40 
 
 		 87 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.363329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0099  hypothetical protein  42.11 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0513827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0775  hypothetical protein  33.7 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0486  hypothetical protein  40.51 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.526318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0809  hypothetical protein  41.56 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.834583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0946  hypothetical protein  36.49 
 
 		 108 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.615167  normal  0.605499 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0886  putative integral membrane protein  35.14 
 
 		 115 aa  40.8  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158506  hitchhiker  0.00123293 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0845  cyclic nucleotide-binding  31.82 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.846806 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>