20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0486 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0486  hypothetical protein  100 
 
 
113 aa  222  1e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.526318  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0946  hypothetical protein  57.8 
 
 
108 aa  111  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.615167  normal  0.605499 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0845  cyclic nucleotide-binding  40.54 
 
 
116 aa  80.9  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.846806 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2918  hypothetical protein  43.27 
 
 
104 aa  77.8  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0665  hypothetical protein  46.24 
 
 
108 aa  75.9  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4330  Protein of unknown function DUF2516  40.57 
 
 
99 aa  74.3  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0886  putative integral membrane protein  38.66 
 
 
115 aa  70.5  0.000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158506  hitchhiker  0.00123293 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0446  hypothetical protein  37.86 
 
 
109 aa  67.8  0.00000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.311832 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3411  putative integral membrane protein  43.3 
 
 
110 aa  65.5  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3084  Protein of unknown function DUF2516  42.42 
 
 
112 aa  65.1  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000115295 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0719  hypothetical protein  37.96 
 
 
117 aa  63.9  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.918882  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3024  hypothetical protein  37.04 
 
 
105 aa  61.6  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25720  Protein of unknown function (DUF2516)  40.48 
 
 
105 aa  55.1  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8229  hypothetical protein  37.5 
 
 
108 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05000  Protein of unknown function (DUF2516)  41.33 
 
 
111 aa  49.7  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0775  hypothetical protein  35.87 
 
 
104 aa  48.5  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4620  hypothetical protein  38.89 
 
 
96 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02500  Protein of unknown function (DUF2516)  39.51 
 
 
99 aa  47.8  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15354  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3657  hypothetical protein  40.51 
 
 
99 aa  44.3  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.199937  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0842  hypothetical protein  32.35 
 
 
100 aa  40  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>