16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3084 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3084  Protein of unknown function DUF2516  100 
 
 
112 aa  211  1.9999999999999998e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000115295 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0886  putative integral membrane protein  50 
 
 
115 aa  87.8  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158506  hitchhiker  0.00123293 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0446  hypothetical protein  44.23 
 
 
109 aa  87  8e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.311832 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3411  putative integral membrane protein  48 
 
 
110 aa  86.7  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0486  hypothetical protein  42.99 
 
 
113 aa  72.4  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.526318  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0845  cyclic nucleotide-binding  42.59 
 
 
116 aa  71.6  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.846806 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05000  Protein of unknown function (DUF2516)  45.92 
 
 
111 aa  72  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0719  hypothetical protein  39.42 
 
 
117 aa  64.7  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.918882  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4620  hypothetical protein  43.56 
 
 
96 aa  61.6  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2918  hypothetical protein  36.89 
 
 
104 aa  61.2  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0665  hypothetical protein  40.43 
 
 
108 aa  58.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0946  hypothetical protein  38.78 
 
 
108 aa  57  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.615167  normal  0.605499 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25720  Protein of unknown function (DUF2516)  35.24 
 
 
105 aa  53.5  0.0000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4330  Protein of unknown function DUF2516  30.1 
 
 
99 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0842  hypothetical protein  36 
 
 
100 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4187  hypothetical protein  32.38 
 
 
97 aa  41.6  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>