23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0886 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0886  putative integral membrane protein  100 
 
 		 115 aa  225  1e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158506  hitchhiker  0.00123293 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0845  cyclic nucleotide-binding  49.58 
 
 		 116 aa  105  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.846806 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0946  hypothetical protein  40.68 
 
 		 108 aa  88.6  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.615167  normal  0.605499 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3084  Protein of unknown function DUF2516  49.5 
 
 		 112 aa  84.3  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000115295 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0719  hypothetical protein  45.45 
 
 		 117 aa  83.2  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.918882  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0486  hypothetical protein  38.66 
 
 		 113 aa  82.4  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.526318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0446  hypothetical protein  38.89 
 
 		 109 aa  80.1  0.000000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.311832 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4330  Protein of unknown function DUF2516  41.41 
 
 		 99 aa  78.2  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0665  hypothetical protein  45.45 
 
 		 108 aa  77.8  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3411  putative integral membrane protein  42.86 
 
 		 110 aa  72.4  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2918  hypothetical protein  36.27 
 
 		 104 aa  70.1  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05000  Protein of unknown function (DUF2516)  47.31 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8229  hypothetical protein  44.44 
 
 		 108 aa  64.7  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4620  hypothetical protein  45.35 
 
 		 96 aa  64.3  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25720  Protein of unknown function (DUF2516)  46.05 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3024  hypothetical protein  33.9 
 
 		 105 aa  50.4  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0842  hypothetical protein  39.18 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0070  hypothetical protein  50.75 
 
 		 93 aa  46.2  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03620  Protein of unknown function (DUF2516)  32.35 
 
 		 122 aa  43.9  0.0007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.693043  normal  0.415319 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10484  transmembrane protein  36.23 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.363329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4187  hypothetical protein  35.87 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03700  hypothetical protein  32.65 
 
 		 98 aa  40.4  0.009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00236427  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3657  hypothetical protein  34.72 
 
 		 99 aa  40  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.199937  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>