20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_05000 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_05000  Protein of unknown function (DUF2516)  100 
 
 		 111 aa  211  3.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0446  hypothetical protein  56.6 
 
 		 109 aa  121  3e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.311832 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3411  putative integral membrane protein  47.78 
 
 		 110 aa  78.2  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0886  putative integral membrane protein  45.83 
 
 		 115 aa  78.2  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158506  hitchhiker  0.00123293 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3084  Protein of unknown function DUF2516  47.37 
 
 		 112 aa  77.8  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000115295 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0845  cyclic nucleotide-binding  42.72 
 
 		 116 aa  75.5  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.846806 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0486  hypothetical protein  37.23 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.526318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25720  Protein of unknown function (DUF2516)  47.92 
 
 		 105 aa  54.3  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0665  hypothetical protein  43.02 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4620  hypothetical protein  42.86 
 
 		 96 aa  50.4  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0719  hypothetical protein  35.58 
 
 		 117 aa  50.4  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.918882  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2918  hypothetical protein  34.02 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3024  hypothetical protein  34.26 
 
 		 105 aa  49.3  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0946  hypothetical protein  39.39 
 
 		 108 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.615167  normal  0.605499 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8229  hypothetical protein  36.27 
 
 		 108 aa  45.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4187  hypothetical protein  33.33 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10484  transmembrane protein  42.25 
 
 		 87 aa  42  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.363329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0842  hypothetical protein  42.17 
 
 		 100 aa  41.2  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3657  hypothetical protein  35.06 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.199937  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4330  Protein of unknown function DUF2516  28.72 
 
 		 99 aa  40  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>