20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0842 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0842  hypothetical protein  100 
 
 		 100 aa  191  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02500  Protein of unknown function (DUF2516)  47.96 
 
 		 99 aa  78.6  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6772  hypothetical protein  51.85 
 
 		 107 aa  74.3  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25648  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0318  hypothetical protein  42.42 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0381  hypothetical protein  41.41 
 
 		 105 aa  60.1  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0467572 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0775  hypothetical protein  40.45 
 
 		 104 aa  57.8  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0845  cyclic nucleotide-binding  35.71 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.846806 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3411  putative integral membrane protein  43.82 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3657  hypothetical protein  39.13 
 
 		 99 aa  51.2  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.199937  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2918  hypothetical protein  37.5 
 
 		 104 aa  50.8  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0886  putative integral membrane protein  40.48 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158506  hitchhiker  0.00123293 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10484  transmembrane protein  37.35 
 
 		 87 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.363329  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4330  Protein of unknown function DUF2516  40 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8229  hypothetical protein  42.11 
 
 		 108 aa  43.9  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0665  hypothetical protein  36.59 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0719  hypothetical protein  37.23 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.918882  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4620  hypothetical protein  36.59 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0809  hypothetical protein  35.8 
 
 		 93 aa  40.8  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.834583  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3084  Protein of unknown function DUF2516  40 
 
 		 112 aa  40.4  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000115295 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0486  hypothetical protein  32.35 
 
 		 113 aa  40  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.526318  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>