20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6772 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6772  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  213  8e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25648  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02500  Protein of unknown function (DUF2516)  52.88 
 
 		 99 aa  110  6e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0842  hypothetical protein  51.85 
 
 		 100 aa  74.3  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10484  transmembrane protein  47.37 
 
 		 87 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.363329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0099  hypothetical protein  40.86 
 
 		 108 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0513827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0809  hypothetical protein  40 
 
 		 93 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.834583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0775  hypothetical protein  36.67 
 
 		 104 aa  58.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0845  cyclic nucleotide-binding  37.63 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.846806 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8229  hypothetical protein  36.36 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4330  Protein of unknown function DUF2516  38.67 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4620  hypothetical protein  38.1 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0381  hypothetical protein  35.42 
 
 		 105 aa  47  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0467572 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0637  hypothetical protein  45.33 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.102221  normal  0.0409068 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0657  hypothetical protein  45.33 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0721883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0719  hypothetical protein  35.64 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.918882  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0644  hypothetical protein  45.33 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.175104  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0318  hypothetical protein  34.41 
 
 		 108 aa  45.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3657  hypothetical protein  38.2 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.199937  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4187  hypothetical protein  36.05 
 
 		 97 aa  45.1  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2918  hypothetical protein  29.67 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>