26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0946 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0946  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  211  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.615167  normal  0.605499 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0486  hypothetical protein  57.8 
 
 
113 aa  130  6.999999999999999e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.526318  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2918  hypothetical protein  44.66 
 
 
104 aa  90.1  8e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0845  cyclic nucleotide-binding  43.64 
 
 
116 aa  89  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.846806 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0665  hypothetical protein  51.72 
 
 
108 aa  87  8e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4330  Protein of unknown function DUF2516  45.65 
 
 
99 aa  80.9  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0886  putative integral membrane protein  42.37 
 
 
115 aa  77  0.00000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158506  hitchhiker  0.00123293 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0446  hypothetical protein  42.31 
 
 
109 aa  75.5  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.311832 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0719  hypothetical protein  40.38 
 
 
117 aa  73.9  0.0000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.918882  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4620  hypothetical protein  41.3 
 
 
96 aa  62  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8229  hypothetical protein  42.53 
 
 
108 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3024  hypothetical protein  30.69 
 
 
105 aa  54.3  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3084  Protein of unknown function DUF2516  39.77 
 
 
112 aa  50.8  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000115295 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25720  Protein of unknown function (DUF2516)  39.19 
 
 
105 aa  50.8  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3411  putative integral membrane protein  35.63 
 
 
110 aa  50.4  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05000  Protein of unknown function (DUF2516)  43.66 
 
 
111 aa  49.7  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3657  hypothetical protein  40.54 
 
 
99 aa  50.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.199937  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02500  Protein of unknown function (DUF2516)  37.97 
 
 
99 aa  48.1  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15354  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0809  hypothetical protein  30.53 
 
 
93 aa  47  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.834583  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0842  hypothetical protein  36.11 
 
 
100 aa  46.2  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0775  hypothetical protein  34.07 
 
 
104 aa  44.3  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0099  hypothetical protein  27.37 
 
 
108 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0513827  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0381  hypothetical protein  32.32 
 
 
105 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0467572 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10484  transmembrane protein  39.73 
 
 
87 aa  41.6  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.363329  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0318  hypothetical protein  32 
 
 
108 aa  40.4  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4187  hypothetical protein  36.49 
 
 
97 aa  40  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>