19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4187 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4187  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  189  8e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8229  hypothetical protein  40.48 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4620  hypothetical protein  46.67 
 
 		 96 aa  61.2  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0809  hypothetical protein  45.95 
 
 		 93 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.834583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0099  hypothetical protein  43.24 
 
 		 108 aa  57  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0513827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02500  Protein of unknown function (DUF2516)  36.47 
 
 		 99 aa  54.3  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10484  transmembrane protein  45.45 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.363329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0446  hypothetical protein  33.33 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.311832 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6772  hypothetical protein  38.2 
 
 		 107 aa  50.8  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25648  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0845  cyclic nucleotide-binding  36.17 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.846806 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3411  putative integral membrane protein  34.83 
 
 		 110 aa  46.2  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0665  hypothetical protein  39.33 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0886  putative integral membrane protein  34.78 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158506  hitchhiker  0.00123293 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0486  hypothetical protein  35.71 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.526318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0842  hypothetical protein  36.08 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0719  hypothetical protein  35.79 
 
 		 117 aa  41.2  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.918882  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25720  Protein of unknown function (DUF2516)  35.9 
 
 		 105 aa  41.6  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05000  Protein of unknown function (DUF2516)  35.56 
 
 		 111 aa  40.4  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3084  Protein of unknown function DUF2516  31.91 
 
 		 112 aa  40.8  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000115295 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>