17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0644 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_0657  hypothetical protein  100 
 
 
94 aa  180  6e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0721883  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0637  hypothetical protein  100 
 
 
94 aa  180  6e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.102221  normal  0.0409068 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0644  hypothetical protein  100 
 
 
94 aa  180  6e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.175104  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10484  transmembrane protein  70.27 
 
 
87 aa  100  5e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.363329  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0809  hypothetical protein  65.96 
 
 
93 aa  98.2  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.834583  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0099  hypothetical protein  66.3 
 
 
108 aa  97.4  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0513827  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02500  Protein of unknown function (DUF2516)  48.05 
 
 
99 aa  74.3  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15354  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6772  hypothetical protein  46.34 
 
 
107 aa  73.6  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25648  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0775  hypothetical protein  41.38 
 
 
104 aa  63.2  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8229  hypothetical protein  45.78 
 
 
108 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4187  hypothetical protein  38.46 
 
 
97 aa  55.1  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4620  hypothetical protein  44.87 
 
 
96 aa  51.2  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3657  hypothetical protein  34.67 
 
 
99 aa  46.6  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.199937  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0845  cyclic nucleotide-binding  35.87 
 
 
116 aa  43.5  0.0009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.846806 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0842  hypothetical protein  37.63 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0446  hypothetical protein  32.26 
 
 
109 aa  43.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.311832 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3411  putative integral membrane protein  40 
 
 
110 aa  41.6  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>