38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0796 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0796  hypothetical protein  100 
 
 
181 aa  352  2e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0916  hypothetical protein  38.42 
 
 
185 aa  109  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1613  protein of unknown function DUF721  35.23 
 
 
190 aa  104  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00599305 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0164  hypothetical protein  38.62 
 
 
185 aa  99.4  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1595  protein of unknown function DUF721  36.07 
 
 
194 aa  99.8  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279023  normal  0.215209 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1572  protein of unknown function DUF721  36.07 
 
 
194 aa  99.8  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4084  hypothetical protein  32.63 
 
 
184 aa  94.7  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00172895 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5098  protein of unknown function DUF721  34.81 
 
 
178 aa  74.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0628947  normal  0.0645069 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04561  hypothetical protein  25.17 
 
 
153 aa  67.8  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04871  hypothetical protein  25.17 
 
 
161 aa  67.4  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0908407  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0431  hypothetical protein  24.34 
 
 
152 aa  64.3  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04941  hypothetical protein  22.99 
 
 
160 aa  64.3  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.67443  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04851  hypothetical protein  26.71 
 
 
139 aa  63.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1777  hypothetical protein  27.75 
 
 
188 aa  63.2  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1763  hypothetical protein  25.85 
 
 
160 aa  62.4  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.893095  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04281  hypothetical protein  25.58 
 
 
176 aa  59.3  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06201  hypothetical protein  26.29 
 
 
180 aa  57  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0388112 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0587  hypothetical protein  27.33 
 
 
173 aa  57  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.683361  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0005  hypothetical protein  30.86 
 
 
185 aa  47.4  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.342856  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0005  hypothetical protein  30.86 
 
 
183 aa  46.2  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0232127  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0005  hypothetical protein  32.22 
 
 
177 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1102  hypothetical protein  39.29 
 
 
155 aa  45.4  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000565832  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1548  protein of unknown function DUF721  31.82 
 
 
160 aa  45.4  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0658767  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0005  protein of unknown function DUF721  30.86 
 
 
185 aa  45.1  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000106889 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3330  hypothetical protein  32.95 
 
 
149 aa  44.7  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2226  hypothetical protein  31.36 
 
 
168 aa  44.3  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000216141  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00040  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  30.86 
 
 
187 aa  44.3  0.0009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  27.71 
 
 
196 aa  43.9  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0005  protein of unknown function DUF721  30.86 
 
 
166 aa  43.5  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0005  hypothetical protein  22.98 
 
 
300 aa  42.4  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0643796  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0005  protein of unknown function DUF721  30.86 
 
 
217 aa  42.7  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00382214 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0005  hypothetical protein  30.86 
 
 
188 aa  42.4  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2673  protein of unknown function DUF721  23.44 
 
 
151 aa  42  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.212988  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0095  Zn-ribbon-containing protein  30 
 
 
101 aa  42  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00142092  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0005  hypothetical protein  26.73 
 
 
173 aa  42  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0499719  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0042  hypothetical protein  26.37 
 
 
155 aa  41.6  0.007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0005  protein of unknown function DUF721  27.16 
 
 
179 aa  40.8  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0638  hypothetical protein  38.81 
 
 
159 aa  40.8  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.128267  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>