28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1911 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1911  HEAT repeat-containing PBS lyase  100 
 
 		 256 aa  510  1e-144  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1054  HEAT repeat-containing PBS lyase  41.25 
 
 		 273 aa  157  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230439  normal  0.0412138 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3485  PBS lyase HEAT domain-containing protein repeat-containing protein  38.75 
 
 		 276 aa  143  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.315582  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0156  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  36.57 
 
 		 284 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00291683 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2934  HEAT repeat-containing PBS lyase  40.07 
 
 		 276 aa  132  5e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3041  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  38.21 
 
 		 284 aa  132  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3079  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  38.21 
 
 		 284 aa  132  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5047  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.86 
 
 		 289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1692  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  40 
 
 		 276 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.312329 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2928  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.11 
 
 		 253 aa  89  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.71825 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0294  PBS lyase HEAT domain-containing protein repeat-containing protein  33.2 
 
 		 261 aa  82.4  0.000000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.936732  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0418  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.96 
 
 		 492 aa  63.5  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.092568  normal  0.037069 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.3 
 
 		 1343 aa  60.5  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.22 
 
 		 192 aa  50.8  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  32.96 
 
 		 1133 aa  50.1  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  32.21 
 
 		 1148 aa  49.3  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0609  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  27.57 
 
 		 822 aa  48.1  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  30 
 
 		 493 aa  48.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  37.11 
 
 		 644 aa  47.4  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0990  HEAT repeat-containing PBS lyase  23.89 
 
 		 425 aa  46.2  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.260401 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  29.08 
 
 		 1094 aa  45.8  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0436  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.46 
 
 		 398 aa  45.4  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.601783  normal  0.423712 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0382  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.56 
 
 		 221 aa  44.3  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.651057 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5731  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  23.59 
 
 		 431 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4512  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  24.7 
 
 		 425 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.0839106  normal  0.594133 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3140  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.48 
 
 		 670 aa  42.7  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0342  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.73 
 
 		 101 aa  42  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.649618 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2127  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.09 
 
 		 823 aa  42  0.009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>