33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0418 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0418  HEAT repeat-containing PBS lyase  100 
 
 		 492 aa  1016    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.092568  normal  0.037069 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0294  PBS lyase HEAT domain-containing protein repeat-containing protein  39.76 
 
 		 261 aa  171  2e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.936732  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2928  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.4 
 
 		 253 aa  169  7e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.71825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5047  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.99 
 
 		 289 aa  146  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0156  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.02 
 
 		 284 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00291683 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3485  PBS lyase HEAT domain-containing protein repeat-containing protein  35.5 
 
 		 276 aa  125  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.315582  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2934  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.21 
 
 		 276 aa  125  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3079  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.08 
 
 		 284 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3041  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.08 
 
 		 284 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1054  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.83 
 
 		 273 aa  110  7.000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230439  normal  0.0412138 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1692  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.2 
 
 		 276 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.312329 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2929  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.36 
 
 		 213 aa  94.4  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0293  PBS lyase HEAT domain-containing protein repeat-containing protein  38.1 
 
 		 151 aa  72.8  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1911  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.96 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.05 
 
 		 1343 aa  61.2  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  23.78 
 
 		 510 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  28 
 
 		 644 aa  53.1  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  24.63 
 
 		 1094 aa  51.6  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  28.43 
 
 		 1224 aa  51.6  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.14 
 
 		 323 aa  50.8  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  28.38 
 
 		 1148 aa  50.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  25.25 
 
 		 493 aa  48.1  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.51 
 
 		 395 aa  48.1  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.73 
 
 		 313 aa  47  0.0009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5731  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  22.19 
 
 		 431 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  23.72 
 
 		 490 aa  46.2  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4512  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  22.6 
 
 		 425 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.0839106  normal  0.594133 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.62 
 
 		 180 aa  45.1  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  25.5 
 
 		 958 aa  45.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4094  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  39.51 
 
 		 522 aa  44.7  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.36 
 
 		 1139 aa  44.3  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3676  HEAT domain containing protein  26.91 
 
 		 886 aa  44.3  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000145397 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.03 
 
 		 1438 aa  43.9  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>