More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1531 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1531  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  100 
 
 
279 aa  551  1e-156  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.341786  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0868  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  69.76 
 
 
249 aa  326  3e-88  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0619282  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19791  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  60.73 
 
 
275 aa  314  9e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0664917 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13461  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  58.61 
 
 
285 aa  289  4e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0757278  normal  0.982465 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0865  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  50.91 
 
 
278 aa  279  3e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.778687  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17181  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  50.36 
 
 
278 aa  274  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.243025  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14601  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  43.88 
 
 
296 aa  248  7e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.12917  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14841  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  43.28 
 
 
237 aa  209  4e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0946217  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14981  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  44.59 
 
 
236 aa  206  3e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.348499  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1395  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  44.59 
 
 
237 aa  204  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1199  tRNA/rRNA methyltransferase  42.04 
 
 
234 aa  154  1e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.354486  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3145  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  37.64 
 
 
260 aa  152  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00100034  normal  0.534513 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2951  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  37.64 
 
 
260 aa  152  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1800  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  37.09 
 
 
265 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3173  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.03 
 
 
261 aa  149  4e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0121288  normal  0.209756 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1436  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  38.89 
 
 
260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0303105  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5040  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  40.29 
 
 
260 aa  146  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4499  tRNA/rRNA methyltransferase SpoU  35.82 
 
 
270 aa  132  6.999999999999999e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.266243  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0808  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.94 
 
 
251 aa  122  7e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1218  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.85 
 
 
246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1196  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.85 
 
 
246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2650  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.27 
 
 
254 aa  115  6e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00276989  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1107  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.71 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1323  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.9 
 
 
266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.411274  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3250  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.43 
 
 
254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2613  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.33 
 
 
285 aa  113  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2039  tRNA/rRNA methyltransferase SpoU  35.51 
 
 
277 aa  112  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0846058  normal  0.928617 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2397  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.33 
 
 
266 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.004624  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2024  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.29 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.146805  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1272  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.29 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.479292  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6073  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.29 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.389176  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2004  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.29 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1379  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.75 
 
 
272 aa  109  6e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000452495  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4688  RNA methyltransferase  30.89 
 
 
254 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000546426  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4305  23S rRNA methyltransferase  32.05 
 
 
254 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0650881  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2037  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.66 
 
 
260 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.859577  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2142  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.43 
 
 
289 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00455486  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1906  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.66 
 
 
260 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.602195 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2063  putative rRNA methylase  34.98 
 
 
275 aa  107  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00825348  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1035  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.52 
 
 
262 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4688  RNA methyltransferase, TrmH family  32.05 
 
 
254 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000539995  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0915  rRNA methylase  32.58 
 
 
255 aa  107  3e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00701819  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0334  rRNA methylase  26.37 
 
 
257 aa  107  3e-22  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.693845  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4673  RNA methyltransferase, TrmH family  31.27 
 
 
265 aa  106  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000176675  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4676  RNA methyltransferase, TrmH family  31.66 
 
 
265 aa  106  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.90567e-34 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5314  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.93 
 
 
260 aa  105  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.300522  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4457  RNA methyltransferase  31.66 
 
 
254 aa  105  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0314134  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4805  RNA methyltransferase  31.66 
 
 
254 aa  105  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00212295  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0720  RNA methyltransferase  31.6 
 
 
246 aa  105  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.186553  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4295  23S rRNA methyltransferase  31.27 
 
 
254 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0566  RNA methyltransferase, TrmH family  30.89 
 
 
265 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000331759  hitchhiker  0.0000000100751 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1853  RNA methyltransferase  24.72 
 
 
257 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0683239  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4393  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.89 
 
 
254 aa  102  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000250925  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2042  RNA methyltransferase  35.61 
 
 
281 aa  102  9e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000542367  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6084  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.85 
 
 
276 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1374  RNA methyltransferase  27.5 
 
 
274 aa  100  2e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0769  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.45 
 
 
267 aa  100  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0615  tRNA/rRNA methyltransferase  36.92 
 
 
260 aa  100  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.136751 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1221  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.84 
 
 
258 aa  100  3e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000766628  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2163  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.03 
 
 
277 aa  99.4  6e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.132475  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0038  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  27.54 
 
 
286 aa  99.4  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.260618 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0462  RNA methyltransferase  27.47 
 
 
255 aa  99  9e-20  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3055  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.69 
 
 
236 aa  97.8  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.915806  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3036  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.21 
 
 
261 aa  97.8  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.142554  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0025  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  29.35 
 
 
286 aa  97.1  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000152428 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1728  rRNA methylase  29.63 
 
 
257 aa  96.7  4e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0218  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.17 
 
 
271 aa  96.3  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000299971  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1222  RNA methyltransferase  23.76 
 
 
267 aa  95.9  6e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0117794  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2415  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.81 
 
 
265 aa  95.9  7e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl258  rRNA methylase  25.75 
 
 
251 aa  95.5  8e-19  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000982584  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05620  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  27.05 
 
 
270 aa  95.5  8e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000147427  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1437  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.87 
 
 
235 aa  95.1  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.418693  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1697  putative RNA methylase  34.07 
 
 
275 aa  94.7  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.595538 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49741  predicted protein  29.57 
 
 
343 aa  94.4  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1312  RNA methyltransferase  34.19 
 
 
262 aa  94  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000359271  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1540  RNA methyltransferase  34.19 
 
 
262 aa  94  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00191583  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2567  RNA methyltransferase  34.06 
 
 
281 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.379619  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3271  RNA methyltransferase  34.19 
 
 
262 aa  94  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000025266  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1753  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.09 
 
 
272 aa  94.4  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0368079  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2421  RNA methyltransferase  34.19 
 
 
262 aa  94  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000000262628  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2040  RNA methyltransferase  34.19 
 
 
262 aa  94  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000808188  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2477  RNA methyltransferase  34.19 
 
 
262 aa  94  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0109767  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11661  23S rRNA methyltransferase tsnR  35.69 
 
 
260 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0053  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  27.54 
 
 
286 aa  93.6  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.87191  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2440  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.43 
 
 
275 aa  93.6  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0504626  normal  0.0195288 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1870  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.89 
 
 
279 aa  93.2  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1878  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.94 
 
 
296 aa  93.2  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.412801 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1885  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.36 
 
 
314 aa  93.2  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.114831  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3166  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.21 
 
 
264 aa  93.2  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.197409  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3068  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.79 
 
 
283 aa  92.8  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.914691 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2787  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.88 
 
 
261 aa  92.4  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2141  RNA methyltransferase  23.97 
 
 
257 aa  92  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1087  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.43 
 
 
266 aa  90.5  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199948  normal  0.0146207 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0294  rRNA methyltransferase  28.41 
 
 
245 aa  90.9  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000126477  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25660  rRNA methylase  34.31 
 
 
257 aa  90.9  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1618  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.32 
 
 
267 aa  90.1  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000197241  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0150  RNA methyltransferase  29.09 
 
 
297 aa  89.7  5e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0145  RNA methyltransferase  29.09 
 
 
297 aa  89.7  5e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.567966  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0162  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  27.6 
 
 
294 aa  89.7  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1437  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  25.44 
 
 
269 aa  89.7  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>