More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_19791 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_19791  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  100 
 
 
275 aa  548  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0664917 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1531  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  60.73 
 
 
279 aa  336  2.9999999999999997e-91  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.341786  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0865  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  54.55 
 
 
278 aa  316  3e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.778687  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17181  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  53.45 
 
 
278 aa  312  4.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.243025  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13461  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  61.99 
 
 
285 aa  311  6.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0757278  normal  0.982465 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0868  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  62.9 
 
 
249 aa  295  8e-79  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0619282  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14601  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  44.4 
 
 
296 aa  250  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.12917  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14841  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  45.53 
 
 
237 aa  224  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0946217  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1395  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  45.8 
 
 
237 aa  218  8.999999999999998e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14981  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  44.68 
 
 
236 aa  213  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.348499  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3173  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  39.41 
 
 
261 aa  174  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0121288  normal  0.209756 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2951  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  39.48 
 
 
260 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3145  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  39.48 
 
 
260 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00100034  normal  0.534513 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1800  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  39.42 
 
 
265 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1436  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  39.78 
 
 
260 aa  160  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0303105  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1199  tRNA/rRNA methyltransferase  42.45 
 
 
234 aa  156  3e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.354486  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5040  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  39.03 
 
 
260 aa  149  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4499  tRNA/rRNA methyltransferase SpoU  37.18 
 
 
270 aa  144  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.266243  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2650  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.21 
 
 
254 aa  122  8e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00276989  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0808  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.59 
 
 
251 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2613  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.65 
 
 
285 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1107  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.82 
 
 
260 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2397  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.32 
 
 
266 aa  112  5e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.004624  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1093  23S rRNA methyltransferase  28.95 
 
 
264 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000062165  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1222  RNA methyltransferase  24.73 
 
 
267 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0117794  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3250  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.12 
 
 
254 aa  109  5e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2163  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.21 
 
 
277 aa  107  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.132475  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1035  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.57 
 
 
262 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0720  RNA methyltransferase  28.62 
 
 
246 aa  106  4e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.186553  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2477  RNA methyltransferase  35.97 
 
 
262 aa  105  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0109767  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1540  RNA methyltransferase  35.97 
 
 
262 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00191583  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2567  RNA methyltransferase  35.97 
 
 
281 aa  105  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.379619  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3271  RNA methyltransferase  35.97 
 
 
262 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000025266  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1312  RNA methyltransferase  35.97 
 
 
262 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000359271  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2421  RNA methyltransferase  35.97 
 
 
262 aa  105  6e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000000262628  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2040  RNA methyltransferase  35.97 
 
 
262 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000808188  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4295  23S rRNA methyltransferase  31.15 
 
 
254 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4673  RNA methyltransferase, TrmH family  30.38 
 
 
265 aa  104  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000176675  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5314  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.33 
 
 
260 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.300522  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49741  predicted protein  29.11 
 
 
343 aa  104  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1196  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.08 
 
 
246 aa  104  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0915  rRNA methylase  30.22 
 
 
255 aa  104  1e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00701819  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1218  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.08 
 
 
246 aa  104  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4688  RNA methyltransferase  30.77 
 
 
254 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000546426  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4457  RNA methyltransferase  30.38 
 
 
254 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0314134  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4305  23S rRNA methyltransferase  30.77 
 
 
254 aa  103  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0650881  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4805  RNA methyltransferase  30.38 
 
 
254 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00212295  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6073  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.1 
 
 
260 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.389176  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4676  RNA methyltransferase, TrmH family  30.38 
 
 
265 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.90567e-34 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2004  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.1 
 
 
260 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05620  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  27.37 
 
 
270 aa  103  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000147427  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0566  RNA methyltransferase, TrmH family  30 
 
 
265 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000331759  hitchhiker  0.0000000100751 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2024  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.23 
 
 
260 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.146805  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4393  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.38 
 
 
254 aa  102  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000250925  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0769  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.73 
 
 
267 aa  102  7e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4688  RNA methyltransferase, TrmH family  30.38 
 
 
254 aa  102  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000539995  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1870  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.41 
 
 
279 aa  102  9e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1272  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36 
 
 
260 aa  101  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.479292  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2042  RNA methyltransferase  34.31 
 
 
281 aa  101  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000542367  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1728  rRNA methylase  30.37 
 
 
257 aa  101  1e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2037  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.61 
 
 
260 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.859577  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0334  rRNA methylase  25.93 
 
 
257 aa  100  3e-20  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.693845  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1906  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.61 
 
 
260 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.602195 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1853  RNA methyltransferase  22.51 
 
 
257 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0683239  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1323  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.04 
 
 
266 aa  100  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.411274  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1374  RNA methyltransferase  25 
 
 
274 aa  99.8  5e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0162  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  29.23 
 
 
294 aa  99.8  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1753  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.14 
 
 
272 aa  99  8e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0368079  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2051  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  29.2 
 
 
254 aa  99  8e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.154178  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0623  rRNA methylase  30 
 
 
252 aa  98.2  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1379  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.88 
 
 
272 aa  97.4  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000452495  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0596  RNA methyltransferase  25.3 
 
 
240 aa  97.4  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2039  tRNA/rRNA methyltransferase SpoU  32.36 
 
 
277 aa  97.4  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0846058  normal  0.928617 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2440  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.59 
 
 
275 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0504626  normal  0.0195288 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1437  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  24.64 
 
 
269 aa  96.3  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3160  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.3 
 
 
257 aa  95.9  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.560125  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1437  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.18 
 
 
235 aa  95.9  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.418693  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1618  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  28.73 
 
 
267 aa  95.5  8e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000197241  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0150  RNA methyltransferase  30.63 
 
 
297 aa  95.5  9e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1697  putative RNA methylase  36.13 
 
 
275 aa  95.5  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.595538 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0145  RNA methyltransferase  30.63 
 
 
297 aa  95.5  9e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.567966  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0218  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.63 
 
 
271 aa  95.5  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000299971  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0537  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.71 
 
 
266 aa  94.7  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0842858  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0053  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  28.06 
 
 
286 aa  93.6  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.87191  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0294  rRNA methyltransferase  30.08 
 
 
245 aa  93.6  3e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000126477  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1268  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  25.95 
 
 
249 aa  93.2  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.806095  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1757  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.84 
 
 
255 aa  92.8  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4637  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.82 
 
 
262 aa  92.8  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0580801  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0038  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  28.67 
 
 
286 aa  92  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.260618 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1221  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.97 
 
 
258 aa  91.3  1e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000766628  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1207  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  25.7 
 
 
270 aa  91.3  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0784669  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2163  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  29.33 
 
 
268 aa  91.7  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0955758  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0414  rRNA methylase  27.46 
 
 
294 aa  91.3  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2141  RNA methyltransferase  22.51 
 
 
257 aa  90.9  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0025  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  28.67 
 
 
286 aa  90.5  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000152428 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1311  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  27.44 
 
 
269 aa  90.1  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.662329  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1616  RNA methyltransferase TrmH, group 3  36.84 
 
 
248 aa  89.7  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.439996 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1016  RNA methyltransferase  26.91 
 
 
234 aa  90.1  4e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3055  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.51 
 
 
236 aa  89  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.915806  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2063  putative rRNA methylase  30.6 
 
 
275 aa  89  8e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00825348  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>