13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2077 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2077  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.466472  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3071  hypothetical protein  50.3 
 
 		 172 aa  181  5.0000000000000004e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.751989  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0072  cytochrome B561  27.22 
 
 		 196 aa  86.7  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3871  putative cytochrome b561  28.81 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.614366  normal  0.414753 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26070  hypothetical protein  25 
 
 		 193 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.702919 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2226  hypothetical protein  25.14 
 
 		 193 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  24.64 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0761  cytochrome B561  26.56 
 
 		 204 aa  43.9  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.599963 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  26.44 
 
 		 180 aa  42.7  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1491  cytochrome b561  28.95 
 
 		 192 aa  42  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.336708  normal  0.0588061 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3420  cytochrome b561 family protein  25.37 
 
 		 197 aa  42  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00251628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1020  cytochrome B561  27.27 
 
 		 191 aa  41.6  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000282036 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  24.6 
 
 		 196 aa  41.2  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>