More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2683 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_2683  inositol-phosphate phosphatase  100 
 
 
266 aa  529  1e-149  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.169796  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1995  inositol monophosphatase  48.8 
 
 
269 aa  238  1e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2434  inositol monophosphatase  43.08 
 
 
268 aa  205  6e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0440  inositol monophosphatase  40.59 
 
 
270 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000464389 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1331  inositol monophosphatase  37.36 
 
 
264 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.686286  normal  0.102778 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0369  inositol monophosphatase  35.34 
 
 
270 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3122  inositol monophosphatase  37.59 
 
 
276 aa  149  6e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.537848 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7112  inositol monophosphatase  38.33 
 
 
273 aa  145  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0508739  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0059  inositol monophosphatase  33.2 
 
 
271 aa  141  8e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1760  inositol monophosphatase  37.86 
 
 
277 aa  132  5e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.538338  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1437  inositol monophosphatase  35.34 
 
 
275 aa  132  6e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.224177  normal  0.162018 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27030  Inositol monophosphatase  34.51 
 
 
274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1687  inositol monophosphatase  38.22 
 
 
272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.889031  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2393  inositol monophosphatase  33.08 
 
 
275 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3188  inositol monophosphatase  33.33 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00000102923  hitchhiker  0.0000000006834 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3030  inositol monophosphatase  31.41 
 
 
293 aa  126  5e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0638536  normal  0.49739 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0480  inositol monophosphatase  35.09 
 
 
285 aa  125  5e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.230677  decreased coverage  0.000552939 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1943  inositol monophosphatase  33.73 
 
 
274 aa  125  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0910476  normal  0.779768 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3111  inositol monophosphatase  32.68 
 
 
269 aa  125  8.000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00096233  hitchhiker  0.000300564 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1934  inositol monophosphatase family protein  33.33 
 
 
273 aa  124  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.780742  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1511  inositol monophosphatase  34.12 
 
 
274 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.931275 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2153  inositol monophosphatase  33.98 
 
 
275 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.945821 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1944  inositol monophosphatase  34.24 
 
 
275 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0143243  normal  0.761582 
 
 
-
 
NC_004310  BR0832  inositol monophosphatase family protein  33.2 
 
 
275 aa  123  4e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.605051  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0825  inositol monophosphatase family protein  33.2 
 
 
275 aa  123  4e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1933  inositol monophosphatase family protein  32.95 
 
 
278 aa  119  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2152  inositol monophosphatase  32.06 
 
 
274 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.962291 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2346  inositol monophosphatase  33.97 
 
 
276 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.960977  normal  0.160347 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6007  inositol-phosphate phosphatase  33.48 
 
 
264 aa  107  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00601575 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1841  inositol monophosphatase  33.33 
 
 
264 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1499  inositol monophosphatase  34.5 
 
 
269 aa  107  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.270636  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2875  inositol-phosphate phosphatase  32.22 
 
 
267 aa  105  6e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000220191 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7280  inositol monophosphatase  33.2 
 
 
264 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0255139  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0612  Inositol-phosphate phosphatase  35.04 
 
 
264 aa  103  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0601  inositol-phosphate phosphatase  35.04 
 
 
264 aa  103  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.406636  normal  0.0239837 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1289  extragenic suppressor protein SuhB  32.25 
 
 
267 aa  103  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077456  normal  0.0155379 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2321  inositol monophosphatase  31.87 
 
 
267 aa  103  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000655872  normal  0.931835 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3711  Inositol-phosphate phosphatase  32.79 
 
 
263 aa  102  7e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0935134 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2855  Inositol-phosphate phosphatase  30.98 
 
 
275 aa  102  8e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3254  inositol monophosphatase family protein  30.98 
 
 
275 aa  102  8e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0576  Inositol-phosphate phosphatase  34.62 
 
 
264 aa  102  9e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.587909  hitchhiker  0.0082747 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2706  inositol monophosphatase  31.23 
 
 
266 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000310915 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1554  inositol monophosphatase  37.45 
 
 
269 aa  100  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.475053  normal  0.933362 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1244  inositol-phosphate phosphatase  32.14 
 
 
266 aa  100  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3216  inositol-phosphate phosphatase  32.43 
 
 
263 aa  100  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1619  inositol-1(or 4)-monophosphatase  33.76 
 
 
267 aa  100  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.28291 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0854  inositol monophosphatase  32.91 
 
 
262 aa  99.8  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1321  inositol-phosphate phosphatase  29.18 
 
 
262 aa  99.4  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0218475  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1772  inositol-phosphate phosphatase  31.69 
 
 
283 aa  99.4  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.32038  hitchhiker  0.00184964 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4320  inositol-1(or 4)-monophosphatase  31.69 
 
 
262 aa  99.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.946675 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2588  inositol-phosphate phosphatase  32.44 
 
 
265 aa  99.4  6e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6932  inositol monophosphatase  34.13 
 
 
263 aa  99  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.538744 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2841  inositol-1(or 4)-monophosphatase  33.33 
 
 
330 aa  98.6  9e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202978  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2428  inositol monophosphatase  32.82 
 
 
267 aa  98.6  9e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.857801  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2518  Inositol-phosphate phosphatase  33.33 
 
 
267 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0217752  hitchhiker  0.00000560671 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1419  inositol-1-monophosphatase  32.1 
 
 
271 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57884  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4616  inositol monophosphatase  31.75 
 
 
272 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00318187  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0274  inositol monophosphate family protein  32.6 
 
 
288 aa  98.2  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.578849  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1076  inositol monophosphatase  32.26 
 
 
263 aa  97.8  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0543949  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1454  inositol monophosphatase  33.06 
 
 
267 aa  98.2  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00259546  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1510  inositol monophosphatase  30.71 
 
 
266 aa  98.2  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2260  extragenic suppressor protein SuhB  31.16 
 
 
267 aa  97.4  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0984  Inositol-phosphate phosphatase  35.32 
 
 
284 aa  97.4  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.594779  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0377  inositol monophosphatase  31.92 
 
 
260 aa  97.4  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2060  inositol-1(or 4)-monophosphatase  31.48 
 
 
282 aa  97.4  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1241  inositol monophosphatase  28.94 
 
 
267 aa  97.1  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.921359  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2390  inositol-phosphate phosphatase  31.88 
 
 
267 aa  97.1  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000252035  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1233  inositol monophosphatase  31.73 
 
 
271 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.901192  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2401  inositol-phosphate phosphatase  31.88 
 
 
267 aa  97.1  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0002318  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0278  inositol-1(or 4)-monophosphatase  32.07 
 
 
268 aa  96.7  3e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1957  Inositol-phosphate phosphatase  31.88 
 
 
267 aa  97.1  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000619286  normal  0.0182477 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2506  inositol-phosphate phosphatase  31.88 
 
 
267 aa  97.1  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.024533  normal  0.0296693 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2153  inositol-phosphate phosphatase  31.56 
 
 
267 aa  96.7  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.38913  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1815  inositol-phosphate phosphatase  31.52 
 
 
267 aa  96.7  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00063204  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1735  inositol-phosphate phosphatase  31.52 
 
 
267 aa  96.3  5e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000203014  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2284  inositol monophosphatase  31.52 
 
 
267 aa  96.3  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00357051  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2101  inositol-phosphate phosphatase  32.11 
 
 
267 aa  95.9  6e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0413503  hitchhiker  0.00162908 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4776  inositol-1(or 4)-monophosphatase  34.7 
 
 
262 aa  95.9  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409036  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0500  Inositol-phosphate phosphatase  29.77 
 
 
261 aa  95.5  7e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2471  inositol monophosphatase family protein  32.65 
 
 
267 aa  95.9  7e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4474  inositol-1(or 4)-monophosphatase  32.27 
 
 
262 aa  95.9  7e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0963  Inositol-phosphate phosphatase  32.09 
 
 
322 aa  95.1  9e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.220962  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0746  inositol-phosphate phosphatase  31.91 
 
 
266 aa  95.1  9e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0802  Inositol-phosphate phosphatase  28.7 
 
 
257 aa  95.1  9e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1045  inositol-phosphate phosphatase  32.09 
 
 
347 aa  95.5  9e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0806171 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1128  inositol-1-monophosphatase  29.63 
 
 
267 aa  94.7  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.768163  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3055  inositol-phosphate phosphatase  31.5 
 
 
262 aa  94.7  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00295141  normal  0.1713 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2746  inositol monophosphatase  29.85 
 
 
267 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139672  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3185  inositol monophosphatase  31.7 
 
 
264 aa  95.1  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.777404  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2095  inositol-phosphate phosphatase  33.64 
 
 
269 aa  95.1  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.064852 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3515  inositol-phosphate phosphatase  31.73 
 
 
271 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.588619 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2972  Inositol-phosphate phosphatase  30.04 
 
 
275 aa  94.4  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.585806  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2808  inositol monophosphatase  29.96 
 
 
267 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0630411  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0158  myo-inositol-1(or 4)-monophosphatase  30.27 
 
 
268 aa  94.7  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.24417 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3507  inositol-phosphate phosphatase  32.17 
 
 
265 aa  94  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.991426  normal  0.0688931 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2921  inositol monophosphatase  29.96 
 
 
267 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0208321  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2892  inositol-1(or 4)-monophosphatase  33.19 
 
 
300 aa  94  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1295  extragenic suppressor protein SuhB  31.37 
 
 
271 aa  94  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1380  inositol-phosphate phosphatase  33.04 
 
 
330 aa  94  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.135454  hitchhiker  0.00587687 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2701  inositol monophosphatase  29.96 
 
 
267 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000859824  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>