More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1233 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_1233  inositol monophosphatase  100 
 
 
271 aa  553  1e-157  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.901192  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1419  inositol-1-monophosphatase  98.52 
 
 
271 aa  548  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57884  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4616  inositol monophosphatase  90.44 
 
 
272 aa  509  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00318187  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14680  extragenic suppressor protein SuhB  87.45 
 
 
271 aa  498  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0838  inositol-phosphate phosphatase  87.87 
 
 
272 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.976712  normal  0.859665 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1295  extragenic suppressor protein SuhB  86.72 
 
 
271 aa  494  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0868  inositol-phosphate phosphatase  87.87 
 
 
272 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.409513 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0881  inositol-phosphate phosphatase  87.5 
 
 
272 aa  494  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0394211 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4340  inositol-phosphate phosphatase  86.4 
 
 
272 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.957686  hitchhiker  0.00000000805299 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3515  inositol-phosphate phosphatase  85.61 
 
 
271 aa  485  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.588619 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40440  Inositol-1-monophosphatase  85.45 
 
 
268 aa  477  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.443027  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1410  inositol-1(or 4)-monophosphatase  60.38 
 
 
267 aa  351  5.9999999999999994e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0719  inositol-1(or 4)-monophosphatase  59.25 
 
 
265 aa  322  5e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000761228  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1244  inositol-phosphate phosphatase  55.81 
 
 
266 aa  313  1.9999999999999998e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1128  inositol-1-monophosphatase  54.24 
 
 
267 aa  311  6.999999999999999e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.768163  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1231  myo-inositol-1(or 4)-monophosphatase  54.72 
 
 
263 aa  307  1.0000000000000001e-82  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0360912  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1280  inositol-1-monophosphatase  54.72 
 
 
266 aa  306  2.0000000000000002e-82  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1712  hypothetical protein  55.09 
 
 
261 aa  306  3e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1712  hypothetical protein  55.09 
 
 
261 aa  306  3e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2063  Inositol-phosphate phosphatase  57.79 
 
 
259 aa  305  4.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.948209  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2282  inositol monophosphatase  60.37 
 
 
266 aa  305  5.0000000000000004e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.476526  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2609  inositol monophosphatase family protein  56.3 
 
 
270 aa  300  1e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2321  inositol monophosphatase  53.87 
 
 
267 aa  301  1e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000655872  normal  0.931835 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1289  extragenic suppressor protein SuhB  53.14 
 
 
267 aa  300  2e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077456  normal  0.0155379 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0826  inositol monophosphatase  56.59 
 
 
272 aa  299  3e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.229284 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2875  inositol-phosphate phosphatase  51.29 
 
 
267 aa  298  8e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000220191 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1160  inositol monophosphatase  53.7 
 
 
268 aa  296  2e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00412225  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2506  inositol-phosphate phosphatase  53.87 
 
 
267 aa  296  2e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.024533  normal  0.0296693 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2390  inositol-phosphate phosphatase  53.87 
 
 
267 aa  296  2e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000252035  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2401  inositol-phosphate phosphatase  53.87 
 
 
267 aa  296  2e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0002318  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1957  Inositol-phosphate phosphatase  53.87 
 
 
267 aa  296  2e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000619286  normal  0.0182477 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0672  inositol-1(or 4)-monophosphatase  55.19 
 
 
273 aa  296  3e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000135062  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1735  inositol-phosphate phosphatase  53.51 
 
 
267 aa  296  3e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000203014  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2284  inositol monophosphatase  53.51 
 
 
267 aa  296  3e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00357051  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2260  extragenic suppressor protein SuhB  53.51 
 
 
267 aa  295  5e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1772  inositol-phosphate phosphatase  52.77 
 
 
283 aa  295  5e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.32038  hitchhiker  0.00184964 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1321  inositol-phosphate phosphatase  53.41 
 
 
262 aa  295  5e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0218475  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1815  inositol-phosphate phosphatase  53.14 
 
 
267 aa  293  1e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00063204  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1101  inositol monophosphatase  53.51 
 
 
267 aa  292  4e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0220453  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02425  inositol monophosphatase  53.51 
 
 
267 aa  291  6e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1135  Inositol-phosphate phosphatase  53.51 
 
 
267 aa  291  6e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.915199  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3765  inositol monophosphatase  53.51 
 
 
267 aa  291  6e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0228752  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1144  inositol monophosphatase  53.51 
 
 
267 aa  291  6e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.221581  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2685  inositol monophosphatase  53.51 
 
 
267 aa  291  6e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000252767  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2818  inositol monophosphatase  53.51 
 
 
267 aa  291  6e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000612182  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02389  hypothetical protein  53.51 
 
 
267 aa  291  6e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.516636  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2686  inositol monophosphatase  53.51 
 
 
267 aa  291  6e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.10987  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2908  inositol monophosphatase  53.51 
 
 
267 aa  291  1e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000930444  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2921  inositol monophosphatase  52.77 
 
 
267 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0208321  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2754  inositol monophosphatase  53.14 
 
 
267 aa  290  2e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00416326  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0813  inositol monophosphatase  53.56 
 
 
268 aa  290  2e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000261138  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2808  inositol monophosphatase  52.77 
 
 
267 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0630411  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2701  inositol monophosphatase  52.77 
 
 
267 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000859824  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2153  inositol-phosphate phosphatase  52.03 
 
 
267 aa  290  2e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.38913  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2787  inositol monophosphatase  52.4 
 
 
267 aa  289  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0013173  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2841  inositol-1(or 4)-monophosphatase  53.79 
 
 
330 aa  288  6e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202978  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1681  inositol monophosphatase  57.78 
 
 
268 aa  287  1e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0669  inositol monophosphate family protein  53.64 
 
 
267 aa  286  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0818  Inositol-phosphate phosphatase  53.64 
 
 
267 aa  286  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0219186  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1241  inositol monophosphatase  52.03 
 
 
267 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.921359  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3034  inositol monophosphatase  52.77 
 
 
267 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.251178  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0614  inositol monophosphatase  51.29 
 
 
266 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000550019  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1796  inositol-phosphate phosphatase  51.89 
 
 
269 aa  285  4e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2746  inositol monophosphatase  52.03 
 
 
267 aa  285  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139672  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1095  Inositol-phosphate phosphatase  51.89 
 
 
270 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.47624 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1619  inositol-1(or 4)-monophosphatase  53.82 
 
 
267 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.28291 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2186  inositol monophosphatase  53.05 
 
 
259 aa  282  4.0000000000000003e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2518  Inositol-phosphate phosphatase  54.26 
 
 
267 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0217752  hitchhiker  0.00000560671 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1001  Inositol-phosphate phosphatase  51.52 
 
 
270 aa  282  5.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.165549  normal  0.0783515 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0854  inositol monophosphatase  52.27 
 
 
262 aa  281  8.000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1273  inositol monophosphatase  51.66 
 
 
267 aa  281  1e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000425107  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1218  inositol-phosphate phosphatase  50.76 
 
 
431 aa  280  1e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1165  inositol monophosphatase  51.66 
 
 
267 aa  281  1e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000142854  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3630  inositol monophosphatase  51.66 
 
 
267 aa  280  1e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0471893  normal  0.858784 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0438  inositol monophosphatase  51.66 
 
 
267 aa  281  1e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450003  hitchhiker  0.0000301386 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1160  inositol monophosphatase  51.52 
 
 
270 aa  280  2e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.728684  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0278  inositol-1(or 4)-monophosphatase  50.92 
 
 
268 aa  280  3e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3030  inositol monophosphatase  51.48 
 
 
268 aa  279  4e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0983926  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2309  inositol-phosphate phosphatase  53.41 
 
 
304 aa  278  5e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.315096 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1454  inositol monophosphatase  52.4 
 
 
267 aa  277  1e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00259546  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0984  Inositol-phosphate phosphatase  51.89 
 
 
284 aa  276  3e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.594779  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01351  inositol-1-monophosphatase  52.55 
 
 
255 aa  275  8e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.104947  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2892  inositol-1(or 4)-monophosphatase  51.18 
 
 
300 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1232  inositol-1(or 4)-monophosphatase  53.49 
 
 
259 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.223718  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2428  inositol monophosphatase  51.29 
 
 
267 aa  271  1e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.857801  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1115  inositol-1(or 4)-monophosphatase  52.45 
 
 
274 aa  270  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1045  inositol-phosphate phosphatase  53.67 
 
 
347 aa  267  1e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0806171 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004363  myo-inositol-1(or 4)-monophosphatase  49.81 
 
 
267 aa  266  2e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000312516  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0963  Inositol-phosphate phosphatase  53.67 
 
 
322 aa  267  2e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.220962  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1078  inositol monophosphatase  52.27 
 
 
273 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.701332  normal  0.180258 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1484  inositol-phosphate phosphatase  51.66 
 
 
266 aa  265  4e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.145709  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4248  inositol-phosphate phosphatase  51.89 
 
 
297 aa  264  1e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0646891  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3566  inositol monophosphatase  49.62 
 
 
353 aa  264  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1397  inositol-phosphate phosphatase  53.1 
 
 
267 aa  263  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500053  hitchhiker  0.000599171 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0274  inositol monophosphate family protein  48.66 
 
 
288 aa  263  2e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.578849  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1380  inositol-phosphate phosphatase  51.57 
 
 
330 aa  262  4.999999999999999e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.135454  hitchhiker  0.00587687 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1934  inositol-1-monophosphatase  51.53 
 
 
363 aa  261  1e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.141779  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3293  inositol-1(or 4)-monophosphatase  50 
 
 
328 aa  260  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.657669  normal  0.273671 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2070  inositol monophosphatase  51.97 
 
 
313 aa  260  2e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.662366  normal  0.672639 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2168  inositol-1-monophosphatase  51.53 
 
 
267 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.289149  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>