More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1933 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_1933  inositol monophosphatase family protein  100 
 
 
278 aa  568  1e-161  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2153  inositol monophosphatase  61.11 
 
 
275 aa  347  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.945821 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1944  inositol monophosphatase  61.48 
 
 
275 aa  346  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0143243  normal  0.761582 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2393  inositol monophosphatase  51.5 
 
 
275 aa  271  9e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0832  inositol monophosphatase family protein  51.88 
 
 
275 aa  264  1e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.605051  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27030  Inositol monophosphatase  47.94 
 
 
274 aa  261  8e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0825  inositol monophosphatase family protein  51.5 
 
 
275 aa  260  1e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1943  inositol monophosphatase  47.19 
 
 
274 aa  254  8e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0910476  normal  0.779768 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1511  inositol monophosphatase  45.69 
 
 
274 aa  249  3e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.931275 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1934  inositol monophosphatase family protein  44.61 
 
 
273 aa  243  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.780742  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2152  inositol monophosphatase  45.9 
 
 
274 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.962291 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0480  inositol monophosphatase  43.94 
 
 
285 aa  223  4e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.230677  decreased coverage  0.000552939 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2346  inositol monophosphatase  43.07 
 
 
276 aa  210  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.960977  normal  0.160347 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1760  inositol monophosphatase  36.53 
 
 
277 aa  191  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.538338  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1437  inositol monophosphatase  37.78 
 
 
275 aa  166  4e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.224177  normal  0.162018 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3030  inositol monophosphatase  34.19 
 
 
293 aa  160  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0638536  normal  0.49739 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3111  inositol monophosphatase  37.45 
 
 
269 aa  156  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00096233  hitchhiker  0.000300564 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1331  inositol monophosphatase  38.06 
 
 
264 aa  155  8e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.686286  normal  0.102778 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2434  inositol monophosphatase  37.64 
 
 
268 aa  146  4.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1687  inositol monophosphatase  36.12 
 
 
272 aa  146  5e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.889031  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3122  inositol monophosphatase  34.94 
 
 
276 aa  135  7.000000000000001e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.537848 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0440  inositol monophosphatase  33.08 
 
 
270 aa  125  9e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000464389 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2683  inositol-phosphate phosphatase  32.95 
 
 
266 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.169796  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0369  inositol monophosphatase  30.5 
 
 
270 aa  119  7.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1995  inositol monophosphatase  34.98 
 
 
269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0059  inositol monophosphatase  29.89 
 
 
271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0673  Inositol-phosphate phosphatase  31.54 
 
 
274 aa  108  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2855  Inositol-phosphate phosphatase  30.4 
 
 
275 aa  107  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3254  inositol monophosphatase family protein  30.4 
 
 
275 aa  107  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1499  inositol monophosphatase  32.08 
 
 
269 aa  104  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.270636  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2717  histidinol-phosphate phosphatase, putative  30.68 
 
 
288 aa  98.6  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0198902  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1838  inositol monophosphatase  29.34 
 
 
269 aa  97.4  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1378  inositol monophosphatase  31.16 
 
 
256 aa  97.8  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000032162  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7112  inositol monophosphatase  33.61 
 
 
273 aa  97.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0508739  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1308  inositol monophosphatase  31.16 
 
 
256 aa  97.1  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.730975  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2060  inositol-1(or 4)-monophosphatase  30 
 
 
282 aa  95.9  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3188  inositol monophosphatase  30.67 
 
 
266 aa  95.9  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00000102923  hitchhiker  0.0000000006834 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0128  inositol monophosphatase  29.92 
 
 
258 aa  94  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1220  histidinol-phosphate phosphatase  30.74 
 
 
278 aa  94  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427245  normal  0.220917 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1407  inositol monophosphatase  32.23 
 
 
263 aa  93.2  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.805923  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0377  inositol monophosphatase  32.05 
 
 
260 aa  92.8  5e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1992  inositol-1-monophosphatase  34.06 
 
 
267 aa  92.4  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0018  inositol monophosphatase  32.56 
 
 
266 aa  92  9e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000389361  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1554  inositol monophosphatase  34.8 
 
 
269 aa  91.7  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.475053  normal  0.933362 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2471  inositol monophosphatase family protein  29.29 
 
 
267 aa  92  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4282  histidinol-phosphate phosphatase, putative  31.4 
 
 
260 aa  91.7  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0345  Inositol-phosphate phosphatase  33.49 
 
 
288 aa  92  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0160878 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5019  histidinol-phosphate phosphatase  29.85 
 
 
263 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.317763  normal  0.049005 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4559  histidinol-phosphate phosphatase  29.85 
 
 
263 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0522743 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1441  inositol-phosphate phosphatase  31.47 
 
 
270 aa  90.9  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1231  myo-inositol-1(or 4)-monophosphatase  30.71 
 
 
263 aa  91.3  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0360912  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1934  Inositol-phosphate phosphatase  33.77 
 
 
277 aa  90.1  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0503138 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1141  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  28.57 
 
 
275 aa  90.1  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5075  histidinol-phosphate phosphatase  29.37 
 
 
263 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0078  inositol-phosphate phosphatase  32.09 
 
 
270 aa  90.1  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.105293 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1280  inositol-1-monophosphatase  29.46 
 
 
266 aa  89.4  7e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1510  inositol monophosphatase  29.15 
 
 
266 aa  89  9e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0197  inositol monophosphatase  28.57 
 
 
284 aa  89  9e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1389  putative inositol monophosphatase family protein  27.82 
 
 
261 aa  88.2  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.000213319  normal  0.368987 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3622  histidinol-phosphate phosphatase  27.45 
 
 
257 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0511822  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01052  hypothetical protein  31.4 
 
 
267 aa  88.6  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4517  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  27.72 
 
 
260 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.158706  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4358  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  28.09 
 
 
260 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.0029628  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2706  inositol monophosphatase  29.78 
 
 
266 aa  87.4  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000310915 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2950  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  27.24 
 
 
261 aa  87  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0973  histidinol-phosphate phosphatase  27.51 
 
 
260 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0782489  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2977  inositol monophosphatase  28.52 
 
 
270 aa  86.7  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.552575 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004363  myo-inositol-1(or 4)-monophosphatase  31.47 
 
 
267 aa  86.3  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000312516  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3323  histidinol-phosphate phosphatase  26.67 
 
 
257 aa  86.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1028  inositol monophosphatase  28.29 
 
 
269 aa  85.9  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00157763  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1076  inositol monophosphatase  30.33 
 
 
263 aa  85.9  7e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0543949  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2841  inositol-1(or 4)-monophosphatase  30.95 
 
 
330 aa  85.5  8e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202978  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1820  inositol monophosphatase  27.49 
 
 
268 aa  85.5  9e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3566  inositol monophosphatase  29.17 
 
 
353 aa  85.1  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1101  inositol monophosphatase  29.66 
 
 
267 aa  85.1  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0220453  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0779  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  29.22 
 
 
261 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.441761 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0043  inositol monophosphatase family protein  31.54 
 
 
258 aa  84.7  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.384486  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02425  inositol monophosphatase  31.02 
 
 
267 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1135  Inositol-phosphate phosphatase  31.02 
 
 
267 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.915199  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1144  inositol monophosphatase  31.02 
 
 
267 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.221581  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0045  inositol monophosphatase family protein  31.54 
 
 
258 aa  84.3  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.51545  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2685  inositol monophosphatase  31.02 
 
 
267 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000252767  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0158  myo-inositol-1(or 4)-monophosphatase  27.98 
 
 
268 aa  84  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.24417 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0995  inositol monophosphatase  28.69 
 
 
266 aa  84.7  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2686  inositol monophosphatase  31.02 
 
 
267 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.10987  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3765  inositol monophosphatase  31.02 
 
 
267 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0228752  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2908  inositol monophosphatase  31.02 
 
 
267 aa  84.3  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000930444  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0004  inositol-phosphate phosphatase  28.51 
 
 
260 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2754  inositol monophosphatase  30.08 
 
 
267 aa  84.3  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00416326  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1244  inositol-phosphate phosphatase  29.51 
 
 
266 aa  84.3  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2818  inositol monophosphatase  31.02 
 
 
267 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000612182  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02389  hypothetical protein  31.02 
 
 
267 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.516636  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3707  Inositol-phosphate phosphatase  32.43 
 
 
272 aa  84  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000252692  hitchhiker  0.000000465281 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1241  inositol monophosphatase  29.58 
 
 
267 aa  83.6  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.921359  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1233  inositol monophosphatase  29.02 
 
 
265 aa  83.6  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.198111  normal  0.286044 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0274  inositol monophosphate family protein  28.81 
 
 
288 aa  83.6  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.578849  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1534  inositol monophosphatase  30.56 
 
 
258 aa  83.2  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0685889  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1876  histidinol-phosphate phosphatase  27.62 
 
 
263 aa  83.2  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2424  inositol-1(or 4)-monophosphatase  33.94 
 
 
248 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2469  inositol-phosphate phosphatase  33.94 
 
 
248 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.113399  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>