More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1076 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A1076  inositol monophosphatase  100 
 
 
263 aa  530  1e-150  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0543949  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3185  inositol monophosphatase  61.2 
 
 
264 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.777404  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1653  inositol monophosphatase family protein  60.47 
 
 
263 aa  326  3e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2101  inositol-phosphate phosphatase  60 
 
 
267 aa  325  6e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0413503  hitchhiker  0.00162908 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0576  Inositol-phosphate phosphatase  62.02 
 
 
264 aa  325  6e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.587909  hitchhiker  0.0082747 
 
 
-
 
NC_004310  BR1711  inositol monophosphatase family protein  60.08 
 
 
263 aa  324  1e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558759  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0612  Inositol-phosphate phosphatase  61.63 
 
 
264 aa  324  1e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1205  inositol-phosphate phosphatase  58.89 
 
 
263 aa  323  1e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.7767  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0601  inositol-phosphate phosphatase  61.63 
 
 
264 aa  324  1e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.406636  normal  0.0239837 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3711  Inositol-phosphate phosphatase  59.77 
 
 
263 aa  323  2e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0935134 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7280  inositol monophosphatase  61.63 
 
 
264 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0255139  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0746  inositol-phosphate phosphatase  59.39 
 
 
266 aa  319  1.9999999999999998e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3672  extragenic suppressor protein SuhB  59.14 
 
 
266 aa  318  5e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0159  inositol monophosphatase family protein  59.53 
 
 
263 aa  317  2e-85  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2665  inositol-phosphate phosphatase  59.53 
 
 
266 aa  315  6e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.887492  normal  0.378141 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6007  inositol-phosphate phosphatase  60.85 
 
 
264 aa  314  8e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00601575 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3216  inositol-phosphate phosphatase  59.22 
 
 
263 aa  312  2.9999999999999996e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3507  inositol-phosphate phosphatase  58.17 
 
 
265 aa  310  2e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.991426  normal  0.0688931 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3055  inositol-phosphate phosphatase  58.53 
 
 
262 aa  309  2.9999999999999997e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00295141  normal  0.1713 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6932  inositol monophosphatase  56.59 
 
 
263 aa  307  9e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.538744 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0707  inositol monophosphatase  61.29 
 
 
262 aa  307  1.0000000000000001e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1707  inositol-phosphate phosphatase  59.55 
 
 
275 aa  304  9.000000000000001e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.168895  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4474  inositol-1(or 4)-monophosphatase  56.98 
 
 
262 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2588  inositol-phosphate phosphatase  55.38 
 
 
265 aa  300  1e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3553  inositol monophosphatase  59.92 
 
 
266 aa  296  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3537  inositol-1(or 4)-monophosphatase  54.26 
 
 
263 aa  296  2e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1007  Inositol-phosphate phosphatase  55.81 
 
 
262 aa  296  2e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3256  Inositol-phosphate phosphatase  60.7 
 
 
266 aa  296  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0330057  normal  0.162821 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0841  inositol monophosphatase  57.54 
 
 
261 aa  294  9e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.800769  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2169  inositol monophosphatase family protein  57.54 
 
 
261 aa  294  9e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.214006  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2740  inositol monophosphatase  56.59 
 
 
263 aa  294  1e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0333138  normal  0.430485 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1501  inositol monophosphatase  56.25 
 
 
278 aa  291  6e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.421731 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4776  inositol-1(or 4)-monophosphatase  55.04 
 
 
262 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409036  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2324  inositol-phosphate phosphatase  56.35 
 
 
261 aa  289  3e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1199  inositol-phosphate phosphatase  55.73 
 
 
264 aa  286  2e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.339227 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4320  inositol-1(or 4)-monophosphatase  54.26 
 
 
262 aa  286  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.946675 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1698  inositol monophosphatase  57.49 
 
 
261 aa  286  2e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.133457  normal  0.97401 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1957  inositol-1(or 4)-monophosphatase  54.31 
 
 
274 aa  274  9e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2981  inositol-phosphate phosphatase  51.49 
 
 
273 aa  271  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.185202 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1028  inositol-1(or 4)-monophosphatase  55.69 
 
 
264 aa  268  5.9999999999999995e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.59391 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1313  inositol-1(or 4)-monophosphatase  50.94 
 
 
272 aa  266  2e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.837993  normal  0.463522 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0078  inositol-phosphate phosphatase  49.01 
 
 
270 aa  252  5.000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.105293 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0826  inositol monophosphatase  47.54 
 
 
272 aa  244  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.229284 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2186  inositol monophosphatase  47.01 
 
 
259 aa  241  7.999999999999999e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1289  extragenic suppressor protein SuhB  45.04 
 
 
267 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077456  normal  0.0155379 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2875  inositol-phosphate phosphatase  42.75 
 
 
267 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000220191 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1772  inositol-phosphate phosphatase  43.51 
 
 
283 aa  236  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.32038  hitchhiker  0.00184964 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1321  inositol-phosphate phosphatase  45.49 
 
 
262 aa  235  5.0000000000000005e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0218475  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2063  Inositol-phosphate phosphatase  46.09 
 
 
259 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.948209  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01351  inositol-1-monophosphatase  45.27 
 
 
255 aa  233  2.0000000000000002e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.104947  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0614  inositol monophosphatase  44.83 
 
 
266 aa  232  4.0000000000000004e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000550019  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1280  inositol-1-monophosphatase  43.19 
 
 
266 aa  232  5e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1231  myo-inositol-1(or 4)-monophosphatase  43.19 
 
 
263 aa  232  6e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0360912  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2401  inositol-phosphate phosphatase  42.37 
 
 
267 aa  230  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0002318  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1957  Inositol-phosphate phosphatase  42.37 
 
 
267 aa  230  1e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000619286  normal  0.0182477 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2390  inositol-phosphate phosphatase  42.37 
 
 
267 aa  230  1e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000252035  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0672  inositol-1(or 4)-monophosphatase  46.27 
 
 
273 aa  231  1e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000135062  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2506  inositol-phosphate phosphatase  42.37 
 
 
267 aa  230  1e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.024533  normal  0.0296693 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2153  inositol-phosphate phosphatase  41.98 
 
 
267 aa  229  3e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.38913  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2609  inositol monophosphatase family protein  48.52 
 
 
270 aa  229  4e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0546  Inositol-phosphate phosphatase  44.75 
 
 
266 aa  227  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2321  inositol monophosphatase  41.6 
 
 
267 aa  226  3e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000655872  normal  0.931835 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1815  inositol-phosphate phosphatase  41.98 
 
 
267 aa  226  4e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00063204  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1735  inositol-phosphate phosphatase  41.98 
 
 
267 aa  225  7e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000203014  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2284  inositol monophosphatase  41.98 
 
 
267 aa  225  7e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00357051  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2260  extragenic suppressor protein SuhB  42.37 
 
 
267 aa  224  9e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0719  inositol-1(or 4)-monophosphatase  44.44 
 
 
265 aa  224  2e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000761228  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3566  inositol monophosphatase  47.03 
 
 
353 aa  223  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2892  inositol-1(or 4)-monophosphatase  46.37 
 
 
300 aa  223  3e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02425  inositol monophosphatase  43.03 
 
 
267 aa  222  4e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1135  Inositol-phosphate phosphatase  43.03 
 
 
267 aa  222  4e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.915199  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2686  inositol monophosphatase  43.03 
 
 
267 aa  222  4e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.10987  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02389  hypothetical protein  43.03 
 
 
267 aa  222  4e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.516636  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3765  inositol monophosphatase  43.03 
 
 
267 aa  222  4e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0228752  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2685  inositol monophosphatase  43.03 
 
 
267 aa  222  4e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000252767  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1144  inositol monophosphatase  43.03 
 
 
267 aa  222  4e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.221581  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1410  inositol-1(or 4)-monophosphatase  43.9 
 
 
267 aa  222  4e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1619  inositol-1(or 4)-monophosphatase  42.75 
 
 
267 aa  222  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.28291 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2818  inositol monophosphatase  43.03 
 
 
267 aa  222  4e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000612182  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1218  inositol-phosphate phosphatase  45.04 
 
 
431 aa  222  4.9999999999999996e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2908  inositol monophosphatase  43.03 
 
 
267 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000930444  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1128  inositol-1-monophosphatase  40.53 
 
 
267 aa  222  6e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.768163  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2746  inositol monophosphatase  42.21 
 
 
267 aa  222  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139672  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2701  inositol monophosphatase  42.62 
 
 
267 aa  221  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000859824  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2518  Inositol-phosphate phosphatase  43.14 
 
 
267 aa  221  7e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0217752  hitchhiker  0.00000560671 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2921  inositol monophosphatase  42.62 
 
 
267 aa  221  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0208321  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2808  inositol monophosphatase  42.62 
 
 
267 aa  221  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0630411  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2428  inositol monophosphatase  43.72 
 
 
267 aa  221  8e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.857801  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2787  inositol monophosphatase  42.21 
 
 
267 aa  220  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0013173  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2282  inositol monophosphatase  46.64 
 
 
266 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.476526  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0543  inositol-phosphate phosphatase  45.24 
 
 
263 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2841  inositol-1(or 4)-monophosphatase  44.14 
 
 
330 aa  218  5e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202978  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0500  Inositol-phosphate phosphatase  44.08 
 
 
261 aa  218  6e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0984  Inositol-phosphate phosphatase  44.53 
 
 
284 aa  218  7e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.594779  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1101  inositol monophosphatase  43.44 
 
 
267 aa  218  7.999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0220453  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1244  inositol-phosphate phosphatase  44.9 
 
 
266 aa  218  7.999999999999999e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2309  inositol-phosphate phosphatase  48.26 
 
 
304 aa  218  7.999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.315096 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3030  inositol monophosphatase  41.53 
 
 
268 aa  218  7.999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0983926  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1454  inositol monophosphatase  43.32 
 
 
267 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00259546  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1241  inositol monophosphatase  41.25 
 
 
267 aa  218  8.999999999999998e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.921359  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>