More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0158 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0158  myo-inositol-1(or 4)-monophosphatase  100 
 
 		 268 aa  542  1e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.24417 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0377  inositol monophosphatase  56.2 
 
 		 260 aa  288  8e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1499  inositol monophosphatase  54.94 
 
 		 269 aa  279  4e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.270636  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2471  inositol monophosphatase family protein  50.2 
 
 		 267 aa  228  1e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0673  Inositol-phosphate phosphatase  46.88 
 
 		 274 aa  223  3e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2855  Inositol-phosphate phosphatase  48.25 
 
 		 275 aa  222  6e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3254  inositol monophosphatase family protein  48.25 
 
 		 275 aa  222  6e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1838  inositol monophosphatase  45.31 
 
 		 269 aa  212  4.9999999999999996e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0995  inositol monophosphatase  43.92 
 
 		 266 aa  201  9.999999999999999e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0197  inositol monophosphatase  47.01 
 
 		 284 aa  196  4.0000000000000005e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2342  inositol monophosphatase  42.75 
 
 		 277 aa  170  2e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1289  extragenic suppressor protein SuhB  38.71 
 
 		 267 aa  136  4e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077456  normal  0.0155379 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2321  inositol monophosphatase  36.79 
 
 		 267 aa  133  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000655872  normal  0.931835 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2875  inositol-phosphate phosphatase  38.79 
 
 		 267 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000220191 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1454  inositol monophosphatase  38.25 
 
 		 267 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00259546  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2428  inositol monophosphatase  35.98 
 
 		 267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.857801  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2153  inositol-phosphate phosphatase  35.98 
 
 		 267 aa  126  3e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.38913  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1233  inositol monophosphatase  39.22 
 
 		 271 aa  125  6e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.901192  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2439  inositol-1-monophosphatase  42.37 
 
 		 315 aa  124  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2390  inositol-phosphate phosphatase  35.98 
 
 		 267 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000252035  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2506  inositol-phosphate phosphatase  35.98 
 
 		 267 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.024533  normal  0.0296693 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2401  inositol-phosphate phosphatase  35.98 
 
 		 267 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0002318  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1957  Inositol-phosphate phosphatase  35.98 
 
 		 267 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000619286  normal  0.0182477 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2260  extragenic suppressor protein SuhB  35.05 
 
 		 267 aa  124  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1419  inositol-1-monophosphatase  40.33 
 
 		 271 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57884  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1815  inositol-phosphate phosphatase  35.51 
 
 		 267 aa  124  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00063204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1772  inositol-phosphate phosphatase  34.26 
 
 		 283 aa  123  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.32038  hitchhiker  0.00184964 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0278  inositol-1(or 4)-monophosphatase  34.04 
 
 		 268 aa  122  5e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4616  inositol monophosphatase  42.07 
 
 		 272 aa  122  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00318187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1735  inositol-phosphate phosphatase  35.05 
 
 		 267 aa  122  6e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000203014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2284  inositol monophosphatase  35.05 
 
 		 267 aa  122  6e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00357051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0222  inositol monophosphatase  40.21 
 
 		 275 aa  121  9.999999999999999e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.320953 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1295  extragenic suppressor protein SuhB  38.73 
 
 		 271 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0246  inositol-1(or 4)-monophosphatase  40.21 
 
 		 275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01351  inositol-1-monophosphatase  35.94 
 
 		 255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.104947  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0881  inositol-phosphate phosphatase  36.68 
 
 		 272 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0394211 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4340  inositol-phosphate phosphatase  36.68 
 
 		 272 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.957686  hitchhiker  0.00000000805299 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0838  inositol-phosphate phosphatase  40.24 
 
 		 272 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.976712  normal  0.859665 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0644  Inositol-phosphate phosphatase  43.89 
 
 		 273 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0868  inositol-phosphate phosphatase  40.24 
 
 		 272 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.409513 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14680  extragenic suppressor protein SuhB  38.24 
 
 		 271 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0274  inositol monophosphate family protein  33.18 
 
 		 288 aa  119  7e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.578849  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0984  Inositol-phosphate phosphatase  36.4 
 
 		 284 aa  119  7e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.594779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2746  inositol monophosphatase  34.58 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1050  Inositol-phosphate phosphatase  37.93 
 
 		 279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0854  inositol monophosphatase  35.29 
 
 		 262 aa  116  3e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3537  inositol-1(or 4)-monophosphatase  37.32 
 
 		 263 aa  116  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2841  inositol-1(or 4)-monophosphatase  34.76 
 
 		 330 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1076  inositol monophosphatase  36.96 
 
 		 263 aa  115  5e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0543949  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2101  inositol-phosphate phosphatase  37.14 
 
 		 267 aa  115  5e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0413503  hitchhiker  0.00162908 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0412  inositol-phosphate phosphatase  40 
 
 		 276 aa  115  5e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0164618 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2908  inositol monophosphatase  33.93 
 
 		 267 aa  115  6e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000930444  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3515  inositol-phosphate phosphatase  40.36 
 
 		 271 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.588619 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1219  Inositol-phosphate phosphatase  38.16 
 
 		 256 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6932  inositol monophosphatase  35.37 
 
 		 263 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.538744 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02425  inositol monophosphatase  34.4 
 
 		 267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1135  Inositol-phosphate phosphatase  34.4 
 
 		 267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.915199  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2701  inositol monophosphatase  34.58 
 
 		 267 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000859824  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02389  hypothetical protein  34.4 
 
 		 267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.516636  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1144  inositol monophosphatase  34.4 
 
 		 267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.221581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2921  inositol monophosphatase  34.58 
 
 		 267 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0208321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2818  inositol monophosphatase  34.4 
 
 		 267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000612182  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2686  inositol monophosphatase  34.4 
 
 		 267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.10987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3765  inositol monophosphatase  34.4 
 
 		 267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0228752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1280  inositol-1-monophosphatase  33.82 
 
 		 266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2685  inositol monophosphatase  34.4 
 
 		 267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000252767  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2808  inositol monophosphatase  34.58 
 
 		 267 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0630411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3030  inositol monophosphatase  33.33 
 
 		 268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0983926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1231  myo-inositol-1(or 4)-monophosphatase  33.82 
 
 		 263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0360912  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40440  Inositol-1-monophosphatase  38.67 
 
 		 268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.443027  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2063  Inositol-phosphate phosphatase  37.43 
 
 		 259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.948209  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2787  inositol monophosphatase  34.11 
 
 		 267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0013173  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2609  inositol monophosphatase family protein  37.57 
 
 		 270 aa  113  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0603  Inositol-phosphate phosphatase  35.19 
 
 		 269 aa  113  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0576  Inositol-phosphate phosphatase  36.41 
 
 		 264 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.587909  hitchhiker  0.0082747 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0601  inositol-phosphate phosphatase  37.86 
 
 		 264 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.406636  normal  0.0239837 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0612  Inositol-phosphate phosphatase  37.86 
 
 		 264 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1484  inositol-phosphate phosphatase  36.92 
 
 		 266 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.145709  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1321  inositol-phosphate phosphatase  35.71 
 
 		 262 aa  112  5e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0218475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004363  myo-inositol-1(or 4)-monophosphatase  39.29 
 
 		 267 aa  112  6e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000312516  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3034  inositol monophosphatase  33.47 
 
 		 267 aa  112  7.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.251178  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1241  inositol monophosphatase  31.97 
 
 		 267 aa  112  8.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.921359  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1995  inositol monophosphatase  32.2 
 
 		 269 aa  112  8.000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1841  inositol monophosphatase  38.76 
 
 		 264 aa  112  9e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1128  inositol-1-monophosphatase  33.05 
 
 		 267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.768163  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2740  inositol monophosphatase  40.12 
 
 		 263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0333138  normal  0.430485 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0719  inositol-1(or 4)-monophosphatase  35.42 
 
 		 265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000761228  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1232  inositol-1(or 4)-monophosphatase  38.46 
 
 		 259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.223718  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0826  inositol monophosphatase  34.88 
 
 		 272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.229284 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1007  Inositol-phosphate phosphatase  34.82 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2754  inositol monophosphatase  32.72 
 
 		 267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00416326  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2282  inositol monophosphatase  34.47 
 
 		 266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.476526  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01052  hypothetical protein  39.51 
 
 		 267 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3355  inositol-phosphate phosphatase  37.05 
 
 		 273 aa  110  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1101  inositol monophosphatase  33.6 
 
 		 267 aa  110  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0220453  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1824  inositol-1(or 4)-monophosphatase  34.57 
 
 		 283 aa  110  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0421706  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3630  inositol monophosphatase  36 
 
 		 267 aa  110  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0471893  normal  0.858784 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3507  inositol-phosphate phosphatase  35.24 
 
 		 265 aa  110  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.991426  normal  0.0688931 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1712  hypothetical protein  30.12 
 
 		 261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1218  inositol-phosphate phosphatase  34.92 
 
 		 431 aa  109  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>