More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1218 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1218  inositol-phosphate phosphatase  100 
 
 		 431 aa  880    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2841  inositol-1(or 4)-monophosphatase  83.39 
 
 		 330 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2892  inositol-1(or 4)-monophosphatase  67.51 
 
 		 300 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3566  inositol monophosphatase  63.17 
 
 		 353 aa  402  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0963  Inositol-phosphate phosphatase  72.45 
 
 		 322 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.220962  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1045  inositol-phosphate phosphatase  72.45 
 
 		 347 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0806171 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2309  inositol-phosphate phosphatase  65.9 
 
 		 304 aa  394  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.315096 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1380  inositol-phosphate phosphatase  62.58 
 
 		 330 aa  389  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.135454  hitchhiker  0.00587687 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3293  inositol-1(or 4)-monophosphatase  70.19 
 
 		 328 aa  386  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.657669  normal  0.273671 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2070  inositol monophosphatase  68.68 
 
 		 313 aa  378  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.662366  normal  0.672639 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1619  inositol-1(or 4)-monophosphatase  66.29 
 
 		 267 aa  373  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.28291 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4248  inositol-phosphate phosphatase  68.68 
 
 		 297 aa  370  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0646891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2518  Inositol-phosphate phosphatase  66.16 
 
 		 267 aa  368  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0217752  hitchhiker  0.00000560671 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1934  inositol-1-monophosphatase  65.06 
 
 		 363 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.141779  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2689  inositol-1-monophosphatase  66.41 
 
 		 320 aa  351  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0179732  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3149  inositol-1-monophosphatase  66.16 
 
 		 267 aa  351  2e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.231747  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1664  inositol-1-monophosphatase  66.16 
 
 		 267 aa  351  2e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0475156  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2605  inositol monophosphatase family protein  66.16 
 
 		 267 aa  351  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2553  inositol monophosphatase family protein  66.16 
 
 		 267 aa  351  2e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1441  inositol-1-monophosphatase  66.16 
 
 		 267 aa  351  2e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115628  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2168  inositol-1-monophosphatase  66.16 
 
 		 267 aa  351  2e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.289149  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1397  inositol-phosphate phosphatase  65.02 
 
 		 267 aa  350  4e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500053  hitchhiker  0.000599171 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1095  Inositol-phosphate phosphatase  60.75 
 
 		 270 aa  348  8e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.47624 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1001  Inositol-phosphate phosphatase  60.75 
 
 		 270 aa  348  1e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.165549  normal  0.0783515 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0854  inositol monophosphatase  60.69 
 
 		 262 aa  348  1e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1160  inositol monophosphatase  61.3 
 
 		 268 aa  347  3e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00412225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0672  inositol-1(or 4)-monophosphatase  59.27 
 
 		 273 aa  346  5e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000135062  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1160  inositol monophosphatase  60.38 
 
 		 270 aa  344  2e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.728684  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0984  Inositol-phosphate phosphatase  59.18 
 
 		 284 aa  340  2.9999999999999998e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.594779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1078  inositol monophosphatase  62.88 
 
 		 273 aa  338  9e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.701332  normal  0.180258 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1115  inositol-1(or 4)-monophosphatase  61.36 
 
 		 274 aa  335  1e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5391  inositol-1(or 4)-monophosphatase  65.15 
 
 		 267 aa  333  3e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.268577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2120  inositol monophosphatase  64.77 
 
 		 267 aa  333  5e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1990  inositol-phosphate phosphatase  64.77 
 
 		 267 aa  333  5e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.410735 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2104  inositol-phosphate phosphatase  64.77 
 
 		 267 aa  332  6e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466762 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5992  inositol monophosphatase  64.77 
 
 		 267 aa  332  6e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2085  inositol monophosphatase  64.77 
 
 		 267 aa  332  6e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.150342  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0813  inositol monophosphatase  59.69 
 
 		 268 aa  328  8e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000261138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1196  inositol-phosphate phosphatase  62.88 
 
 		 294 aa  325  7e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0278883 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2282  inositol monophosphatase  62.84 
 
 		 266 aa  322  7e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.476526  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1681  inositol monophosphatase  63.57 
 
 		 268 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2153  inositol-phosphate phosphatase  56.92 
 
 		 267 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.38913  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2506  inositol-phosphate phosphatase  57.31 
 
 		 267 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.024533  normal  0.0296693 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1957  Inositol-phosphate phosphatase  57.31 
 
 		 267 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000619286  normal  0.0182477 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2390  inositol-phosphate phosphatase  57.31 
 
 		 267 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000252035  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2401  inositol-phosphate phosphatase  57.31 
 
 		 267 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0002318  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1815  inositol-phosphate phosphatase  56.92 
 
 		 267 aa  301  2e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00063204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1735  inositol-phosphate phosphatase  56.92 
 
 		 267 aa  300  5e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000203014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2284  inositol monophosphatase  56.92 
 
 		 267 aa  300  5e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00357051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2875  inositol-phosphate phosphatase  55.38 
 
 		 267 aa  299  5e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000220191 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2260  extragenic suppressor protein SuhB  56.15 
 
 		 267 aa  298  2e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1231  myo-inositol-1(or 4)-monophosphatase  54.83 
 
 		 263 aa  296  5e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0360912  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1772  inositol-phosphate phosphatase  55 
 
 		 283 aa  295  1e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.32038  hitchhiker  0.00184964 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1280  inositol-1-monophosphatase  54.44 
 
 		 266 aa  295  1e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1289  extragenic suppressor protein SuhB  55.38 
 
 		 267 aa  295  1e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077456  normal  0.0155379 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2321  inositol monophosphatase  54.62 
 
 		 267 aa  293  5e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000655872  normal  0.931835 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1712  hypothetical protein  52.85 
 
 		 261 aa  291  1e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1712  hypothetical protein  52.85 
 
 		 261 aa  291  1e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1454  inositol monophosphatase  56.92 
 
 		 267 aa  291  2e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00259546  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0826  inositol monophosphatase  52.71 
 
 		 272 aa  290  3e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.229284 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2063  Inositol-phosphate phosphatase  55.98 
 
 		 259 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.948209  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0818  Inositol-phosphate phosphatase  53.49 
 
 		 267 aa  286  5.999999999999999e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0219186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0669  inositol monophosphate family protein  53.49 
 
 		 267 aa  286  5.999999999999999e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0719  inositol-1(or 4)-monophosphatase  51.54 
 
 		 265 aa  282  8.000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000761228  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14680  extragenic suppressor protein SuhB  51.14 
 
 		 271 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1233  inositol monophosphatase  50.76 
 
 		 271 aa  280  3e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.901192  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2428  inositol monophosphatase  55.38 
 
 		 267 aa  280  3e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.857801  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1419  inositol-1-monophosphatase  50.38 
 
 		 271 aa  280  5e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57884  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1244  inositol-phosphate phosphatase  51.72 
 
 		 266 aa  279  7e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1128  inositol-1-monophosphatase  51.34 
 
 		 267 aa  277  2e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.768163  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1295  extragenic suppressor protein SuhB  50 
 
 		 271 aa  276  5e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2186  inositol monophosphatase  51.17 
 
 		 259 aa  276  5e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4616  inositol monophosphatase  50.19 
 
 		 272 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00318187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1410  inositol-1(or 4)-monophosphatase  48.13 
 
 		 267 aa  270  4e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0881  inositol-phosphate phosphatase  49.43 
 
 		 272 aa  270  5e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0394211 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02425  inositol monophosphatase  52.16 
 
 		 267 aa  268  1e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1135  Inositol-phosphate phosphatase  52.16 
 
 		 267 aa  268  1e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.915199  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0838  inositol-phosphate phosphatase  48.68 
 
 		 272 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.976712  normal  0.859665 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2701  inositol monophosphatase  52.16 
 
 		 267 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000859824  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1796  inositol-phosphate phosphatase  50.19 
 
 		 269 aa  268  1e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0868  inositol-phosphate phosphatase  48.68 
 
 		 272 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.409513 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2818  inositol monophosphatase  52.16 
 
 		 267 aa  268  1e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000612182  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2686  inositol monophosphatase  52.16 
 
 		 267 aa  268  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.10987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1144  inositol monophosphatase  52.16 
 
 		 267 aa  268  1e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.221581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2921  inositol monophosphatase  52.16 
 
 		 267 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0208321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2685  inositol monophosphatase  52.16 
 
 		 267 aa  268  1e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000252767  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2808  inositol monophosphatase  52.16 
 
 		 267 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0630411  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02389  hypothetical protein  52.16 
 
 		 267 aa  268  1e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.516636  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3515  inositol-phosphate phosphatase  48.86 
 
 		 271 aa  268  1e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.588619 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3765  inositol monophosphatase  52.16 
 
 		 267 aa  268  1e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0228752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01351  inositol-1-monophosphatase  52.55 
 
 		 255 aa  267  2e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.104947  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4340  inositol-phosphate phosphatase  49.06 
 
 		 272 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.957686  hitchhiker  0.00000000805299 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004363  myo-inositol-1(or 4)-monophosphatase  52.21 
 
 		 267 aa  268  2e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000312516  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2908  inositol monophosphatase  52.16 
 
 		 267 aa  268  2e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000930444  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2746  inositol monophosphatase  51.76 
 
 		 267 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2787  inositol monophosphatase  51.76 
 
 		 267 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0013173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1484  inositol-phosphate phosphatase  55 
 
 		 266 aa  264  2e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.145709  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1101  inositol monophosphatase  50.78 
 
 		 267 aa  265  2e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0220453  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1232  inositol-1(or 4)-monophosphatase  50.78 
 
 		 259 aa  264  2e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.223718  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40440  Inositol-1-monophosphatase  50.19 
 
 		 268 aa  263  4e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.443027  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>