More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_4320 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_4320  inositol-1(or 4)-monophosphatase  100 
 
 		 262 aa  533  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.946675 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4474  inositol-1(or 4)-monophosphatase  92.72 
 
 		 262 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1007  Inositol-phosphate phosphatase  88.89 
 
 		 262 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4776  inositol-1(or 4)-monophosphatase  84.29 
 
 		 262 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6932  inositol monophosphatase  78.08 
 
 		 263 aa  432  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.538744 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3537  inositol-1(or 4)-monophosphatase  78.71 
 
 		 263 aa  428  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2740  inositol monophosphatase  78.33 
 
 		 263 aa  408  1e-113  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0333138  normal  0.430485 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2101  inositol-phosphate phosphatase  62.02 
 
 		 267 aa  339  2e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0413503  hitchhiker  0.00162908 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3216  inositol-phosphate phosphatase  59.77 
 
 		 263 aa  333  2e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3055  inositol-phosphate phosphatase  59.62 
 
 		 262 aa  331  7.000000000000001e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00295141  normal  0.1713 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3672  extragenic suppressor protein SuhB  60.46 
 
 		 266 aa  325  6e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3711  Inositol-phosphate phosphatase  59 
 
 		 263 aa  323  1e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0935134 
 
 
-
 
NC_004310  BR1711  inositol monophosphatase family protein  60.38 
 
 		 263 aa  323  1e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558759  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1653  inositol monophosphatase family protein  60.38 
 
 		 263 aa  324  1e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3185  inositol monophosphatase  60.84 
 
 		 264 aa  324  1e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.777404  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2665  inositol-phosphate phosphatase  60.38 
 
 		 266 aa  323  2e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.887492  normal  0.378141 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1205  inositol-phosphate phosphatase  58.94 
 
 		 263 aa  318  3.9999999999999996e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.7767  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0576  Inositol-phosphate phosphatase  60 
 
 		 264 aa  318  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.587909  hitchhiker  0.0082747 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0601  inositol-phosphate phosphatase  59.23 
 
 		 264 aa  318  6e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.406636  normal  0.0239837 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0612  Inositol-phosphate phosphatase  59.23 
 
 		 264 aa  318  6e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0159  inositol monophosphatase family protein  59.62 
 
 		 263 aa  317  1e-85  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2588  inositol-phosphate phosphatase  57.98 
 
 		 265 aa  312  3.9999999999999997e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0746  inositol-phosphate phosphatase  59.36 
 
 		 266 aa  310  1e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6007  inositol-phosphate phosphatase  57.31 
 
 		 264 aa  308  4e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00601575 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7280  inositol monophosphatase  57.31 
 
 		 264 aa  308  6.999999999999999e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0255139  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3553  inositol monophosphatase  58.85 
 
 		 266 aa  301  7.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3256  Inositol-phosphate phosphatase  59.23 
 
 		 266 aa  301  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0330057  normal  0.162821 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3507  inositol-phosphate phosphatase  53.82 
 
 		 265 aa  300  2e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.991426  normal  0.0688931 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1076  inositol monophosphatase  54.26 
 
 		 263 aa  286  2e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0543949  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1313  inositol-1(or 4)-monophosphatase  52.83 
 
 		 272 aa  286  2e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.837993  normal  0.463522 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2169  inositol monophosphatase family protein  50.58 
 
 		 261 aa  280  1e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.214006  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0841  inositol monophosphatase  50.58 
 
 		 261 aa  280  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.800769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2324  inositol-phosphate phosphatase  49.81 
 
 		 261 aa  276  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1698  inositol monophosphatase  49.23 
 
 		 261 aa  276  2e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.133457  normal  0.97401 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2981  inositol-phosphate phosphatase  51.71 
 
 		 273 aa  275  7e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.185202 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1028  inositol-1(or 4)-monophosphatase  50.57 
 
 		 264 aa  271  8.000000000000001e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.59391 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0707  inositol monophosphatase  50.19 
 
 		 262 aa  266  2e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1199  inositol-phosphate phosphatase  50 
 
 		 264 aa  264  1e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.339227 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1501  inositol monophosphatase  51.66 
 
 		 278 aa  261  8.999999999999999e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.421731 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1957  inositol-1(or 4)-monophosphatase  52.47 
 
 		 274 aa  258  5.0000000000000005e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1707  inositol-phosphate phosphatase  49.43 
 
 		 275 aa  250  1e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.168895  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0672  inositol-1(or 4)-monophosphatase  45 
 
 		 273 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000135062  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2153  inositol-phosphate phosphatase  44.75 
 
 		 267 aa  225  6e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.38913  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2186  inositol monophosphatase  43.8 
 
 		 259 aa  224  8e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1289  extragenic suppressor protein SuhB  44.75 
 
 		 267 aa  224  1e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077456  normal  0.0155379 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2401  inositol-phosphate phosphatase  45.53 
 
 		 267 aa  223  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0002318  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2390  inositol-phosphate phosphatase  45.53 
 
 		 267 aa  223  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000252035  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1957  Inositol-phosphate phosphatase  45.53 
 
 		 267 aa  223  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000619286  normal  0.0182477 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2506  inositol-phosphate phosphatase  45.53 
 
 		 267 aa  223  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.024533  normal  0.0296693 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2260  extragenic suppressor protein SuhB  44.75 
 
 		 267 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2892  inositol-1(or 4)-monophosphatase  46.27 
 
 		 300 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1735  inositol-phosphate phosphatase  44.36 
 
 		 267 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000203014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2284  inositol monophosphatase  44.36 
 
 		 267 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00357051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1772  inositol-phosphate phosphatase  42.75 
 
 		 283 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.32038  hitchhiker  0.00184964 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1454  inositol monophosphatase  45.71 
 
 		 267 aa  219  3e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00259546  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1815  inositol-phosphate phosphatase  43.97 
 
 		 267 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00063204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2282  inositol monophosphatase  45.17 
 
 		 266 aa  219  5e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.476526  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0813  inositol monophosphatase  45.31 
 
 		 268 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000261138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0984  Inositol-phosphate phosphatase  43.53 
 
 		 284 aa  217  1e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.594779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1218  inositol-phosphate phosphatase  43.3 
 
 		 431 aa  217  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2518  Inositol-phosphate phosphatase  43.14 
 
 		 267 aa  216  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0217752  hitchhiker  0.00000560671 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0818  Inositol-phosphate phosphatase  43.89 
 
 		 267 aa  216  2e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0219186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2875  inositol-phosphate phosphatase  42.35 
 
 		 267 aa  217  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000220191 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0078  inositol-phosphate phosphatase  42.8 
 
 		 270 aa  216  2e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105293 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0669  inositol monophosphate family protein  43.89 
 
 		 267 aa  216  2e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2841  inositol-1(or 4)-monophosphatase  44.36 
 
 		 330 aa  216  4e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1231  myo-inositol-1(or 4)-monophosphatase  40.93 
 
 		 263 aa  216  4e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0360912  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0854  inositol monophosphatase  42.75 
 
 		 262 aa  216  4e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2428  inositol monophosphatase  45.31 
 
 		 267 aa  215  5e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.857801  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1280  inositol-1-monophosphatase  40.94 
 
 		 266 aa  215  5.9999999999999996e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1619  inositol-1(or 4)-monophosphatase  42.75 
 
 		 267 aa  214  9e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.28291 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0826  inositol monophosphatase  43.5 
 
 		 272 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.229284 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1712  hypothetical protein  42.31 
 
 		 261 aa  212  4.9999999999999996e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1712  hypothetical protein  42.31 
 
 		 261 aa  212  4.9999999999999996e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0719  inositol-1(or 4)-monophosphatase  42.02 
 
 		 265 aa  209  3e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000761228  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2321  inositol monophosphatase  41.18 
 
 		 267 aa  209  3e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000655872  normal  0.931835 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1681  inositol monophosphatase  44.23 
 
 		 268 aa  209  4e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1410  inositol-1(or 4)-monophosphatase  40.15 
 
 		 267 aa  208  7e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1160  inositol monophosphatase  39.23 
 
 		 268 aa  207  2e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00412225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1244  inositol-phosphate phosphatase  41.63 
 
 		 266 aa  206  3e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0018  inositol monophosphatase  42.52 
 
 		 266 aa  205  5e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000389361  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2609  inositol monophosphatase family protein  42.19 
 
 		 270 aa  204  2e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2063  Inositol-phosphate phosphatase  42.58 
 
 		 259 aa  203  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.948209  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3515  inositol-phosphate phosphatase  41.98 
 
 		 271 aa  204  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.588619 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01351  inositol-1-monophosphatase  41.96 
 
 		 255 aa  203  3e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.104947  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1095  Inositol-phosphate phosphatase  39.85 
 
 		 270 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.47624 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1160  inositol monophosphatase  39.69 
 
 		 270 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.728684  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3566  inositol monophosphatase  42.58 
 
 		 353 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1001  Inositol-phosphate phosphatase  39.85 
 
 		 270 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.165549  normal  0.0783515 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1295  extragenic suppressor protein SuhB  40.84 
 
 		 271 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1397  inositol-phosphate phosphatase  43.14 
 
 		 267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500053  hitchhiker  0.000599171 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1796  inositol-phosphate phosphatase  40.08 
 
 		 269 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14680  extragenic suppressor protein SuhB  40.46 
 
 		 271 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0963  Inositol-phosphate phosphatase  43.14 
 
 		 322 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.220962  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3293  inositol-1(or 4)-monophosphatase  42.35 
 
 		 328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.657669  normal  0.273671 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1078  inositol monophosphatase  41.98 
 
 		 273 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.701332  normal  0.180258 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1380  inositol-phosphate phosphatase  42.75 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.135454  hitchhiker  0.00587687 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1045  inositol-phosphate phosphatase  43.24 
 
 		 347 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0806171 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1233  inositol monophosphatase  40.23 
 
 		 271 aa  196  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.901192  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0614  inositol monophosphatase  38.91 
 
 		 266 aa  196  3e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000550019  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>