More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4776 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_4776  inositol-1(or 4)-monophosphatase  100 
 
 
262 aa  534  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409036  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4320  inositol-1(or 4)-monophosphatase  84.29 
 
 
262 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.946675 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4474  inositol-1(or 4)-monophosphatase  81.3 
 
 
262 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1007  Inositol-phosphate phosphatase  80.15 
 
 
262 aa  447  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6932  inositol monophosphatase  78.85 
 
 
263 aa  437  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.538744 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3537  inositol-1(or 4)-monophosphatase  79.77 
 
 
263 aa  432  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2740  inositol monophosphatase  79.39 
 
 
263 aa  412  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0333138  normal  0.430485 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2101  inositol-phosphate phosphatase  62.79 
 
 
267 aa  346  2e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0413503  hitchhiker  0.00162908 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3672  extragenic suppressor protein SuhB  60.84 
 
 
266 aa  335  5.999999999999999e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3711  Inositol-phosphate phosphatase  59.39 
 
 
263 aa  328  5.0000000000000004e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0935134 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3185  inositol monophosphatase  58.85 
 
 
264 aa  323  2e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.777404  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0159  inositol monophosphatase family protein  59.23 
 
 
263 aa  323  2e-87  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0576  Inositol-phosphate phosphatase  60.77 
 
 
264 aa  322  3e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.587909  hitchhiker  0.0082747 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2665  inositol-phosphate phosphatase  60.08 
 
 
266 aa  322  3e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.887492  normal  0.378141 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3055  inositol-phosphate phosphatase  56.92 
 
 
262 aa  322  4e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00295141  normal  0.1713 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0601  inositol-phosphate phosphatase  60 
 
 
264 aa  322  5e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.406636  normal  0.0239837 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0612  Inositol-phosphate phosphatase  60 
 
 
264 aa  322  5e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3216  inositol-phosphate phosphatase  56.32 
 
 
263 aa  318  6e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1653  inositol monophosphatase family protein  58.08 
 
 
263 aa  318  7.999999999999999e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1711  inositol monophosphatase family protein  57.69 
 
 
263 aa  316  2e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558759  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2588  inositol-phosphate phosphatase  57.59 
 
 
265 aa  313  9.999999999999999e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1205  inositol-phosphate phosphatase  57.03 
 
 
263 aa  312  2.9999999999999996e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.7767  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7280  inositol monophosphatase  57.69 
 
 
264 aa  310  1e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0255139  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6007  inositol-phosphate phosphatase  57.31 
 
 
264 aa  307  9e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00601575 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0746  inositol-phosphate phosphatase  57.6 
 
 
266 aa  306  2.0000000000000002e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3507  inositol-phosphate phosphatase  54.75 
 
 
265 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.991426  normal  0.0688931 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3553  inositol monophosphatase  57.79 
 
 
266 aa  299  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3256  Inositol-phosphate phosphatase  58.56 
 
 
266 aa  298  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0330057  normal  0.162821 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1076  inositol monophosphatase  55.04 
 
 
263 aa  290  2e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0543949  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1313  inositol-1(or 4)-monophosphatase  53.21 
 
 
272 aa  286  2e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.837993  normal  0.463522 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1698  inositol monophosphatase  51.15 
 
 
261 aa  284  8e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.133457  normal  0.97401 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0841  inositol monophosphatase  51.35 
 
 
261 aa  281  6.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.800769  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2169  inositol monophosphatase family protein  51.35 
 
 
261 aa  281  6.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.214006  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2324  inositol-phosphate phosphatase  50.58 
 
 
261 aa  277  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1028  inositol-1(or 4)-monophosphatase  51.34 
 
 
264 aa  274  1.0000000000000001e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.59391 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0707  inositol monophosphatase  51.35 
 
 
262 aa  269  4e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2981  inositol-phosphate phosphatase  52.03 
 
 
273 aa  268  8e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.185202 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1199  inositol-phosphate phosphatase  51.16 
 
 
264 aa  267  1e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.339227 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1501  inositol monophosphatase  52.03 
 
 
278 aa  266  2.9999999999999995e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.421731 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1707  inositol-phosphate phosphatase  51.71 
 
 
275 aa  265  7e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.168895  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1957  inositol-1(or 4)-monophosphatase  50.95 
 
 
274 aa  249  2e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2186  inositol monophosphatase  45.74 
 
 
259 aa  231  7.000000000000001e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0672  inositol-1(or 4)-monophosphatase  45.38 
 
 
273 aa  228  9e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000135062  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1289  extragenic suppressor protein SuhB  45.14 
 
 
267 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077456  normal  0.0155379 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0719  inositol-1(or 4)-monophosphatase  45.91 
 
 
265 aa  222  4e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000761228  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1772  inositol-phosphate phosphatase  42.41 
 
 
283 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.32038  hitchhiker  0.00184964 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2282  inositol monophosphatase  46.36 
 
 
266 aa  218  5e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.476526  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1231  myo-inositol-1(or 4)-monophosphatase  42.08 
 
 
263 aa  217  1e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0360912  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2892  inositol-1(or 4)-monophosphatase  45.56 
 
 
300 aa  217  1e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2153  inositol-phosphate phosphatase  43.58 
 
 
267 aa  216  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.38913  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0813  inositol monophosphatase  44.4 
 
 
268 aa  217  2e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000261138  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0078  inositol-phosphate phosphatase  42.02 
 
 
270 aa  217  2e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.105293 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1280  inositol-1-monophosphatase  42.13 
 
 
266 aa  216  2.9999999999999998e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1957  Inositol-phosphate phosphatase  44.36 
 
 
267 aa  214  8e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000619286  normal  0.0182477 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2506  inositol-phosphate phosphatase  44.36 
 
 
267 aa  214  8e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.024533  normal  0.0296693 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2390  inositol-phosphate phosphatase  44.36 
 
 
267 aa  214  8e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000252035  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2401  inositol-phosphate phosphatase  44.36 
 
 
267 aa  214  8e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0002318  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1735  inositol-phosphate phosphatase  43.58 
 
 
267 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000203014  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2284  inositol monophosphatase  43.58 
 
 
267 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00357051  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2260  extragenic suppressor protein SuhB  43.58 
 
 
267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1681  inositol monophosphatase  46.15 
 
 
268 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1454  inositol monophosphatase  44.9 
 
 
267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00259546  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1815  inositol-phosphate phosphatase  43.19 
 
 
267 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00063204  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0984  Inositol-phosphate phosphatase  44.09 
 
 
284 aa  212  4.9999999999999996e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.594779  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0854  inositol monophosphatase  43.31 
 
 
262 aa  212  5.999999999999999e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2063  Inositol-phosphate phosphatase  45.64 
 
 
259 aa  211  9e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.948209  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0818  Inositol-phosphate phosphatase  40.93 
 
 
267 aa  211  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0219186  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0669  inositol monophosphate family protein  40.93 
 
 
267 aa  211  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1712  hypothetical protein  42.69 
 
 
261 aa  210  2e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1712  hypothetical protein  42.69 
 
 
261 aa  210  2e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1218  inositol-phosphate phosphatase  42.91 
 
 
431 aa  210  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2841  inositol-1(or 4)-monophosphatase  43.68 
 
 
330 aa  209  4e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202978  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0826  inositol monophosphatase  43.09 
 
 
272 aa  209  4e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.229284 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2518  Inositol-phosphate phosphatase  42.91 
 
 
267 aa  209  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0217752  hitchhiker  0.00000560671 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2428  inositol monophosphatase  44.9 
 
 
267 aa  209  4e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.857801  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2875  inositol-phosphate phosphatase  40.08 
 
 
267 aa  207  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000220191 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1410  inositol-1(or 4)-monophosphatase  41.31 
 
 
267 aa  207  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1619  inositol-1(or 4)-monophosphatase  42.52 
 
 
267 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.28291 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0018  inositol monophosphatase  41.5 
 
 
266 aa  206  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000389361  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1160  inositol monophosphatase  38.85 
 
 
268 aa  206  3e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00412225  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01351  inositol-1-monophosphatase  42.35 
 
 
255 aa  206  3e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.104947  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2609  inositol monophosphatase family protein  44.14 
 
 
270 aa  205  5e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2321  inositol monophosphatase  40.08 
 
 
267 aa  204  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000655872  normal  0.931835 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1244  inositol-phosphate phosphatase  41.25 
 
 
266 aa  203  3e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0614  inositol monophosphatase  39.69 
 
 
266 aa  201  9.999999999999999e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000550019  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1160  inositol monophosphatase  39.85 
 
 
270 aa  199  3e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.728684  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004363  myo-inositol-1(or 4)-monophosphatase  41.15 
 
 
267 aa  199  3e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000312516  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0274  inositol monophosphate family protein  40.74 
 
 
288 aa  199  3e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.578849  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1796  inositol-phosphate phosphatase  41.25 
 
 
269 aa  198  7e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3293  inositol-1(or 4)-monophosphatase  42.08 
 
 
328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.657669  normal  0.273671 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0963  Inositol-phosphate phosphatase  41.7 
 
 
322 aa  196  5.000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.220962  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1045  inositol-phosphate phosphatase  41.7 
 
 
347 aa  195  5.000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0806171 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3515  inositol-phosphate phosphatase  41.92 
 
 
271 aa  195  6e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.588619 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3566  inositol monophosphatase  40.93 
 
 
353 aa  195  7e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1295  extragenic suppressor protein SuhB  40.08 
 
 
271 aa  194  8.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1095  Inositol-phosphate phosphatase  37.93 
 
 
270 aa  195  8.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.47624 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1135  Inositol-phosphate phosphatase  41.46 
 
 
267 aa  194  9e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.915199  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2686  inositol monophosphatase  41.46 
 
 
267 aa  194  9e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.10987  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1001  Inositol-phosphate phosphatase  37.93 
 
 
270 aa  194  9e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.165549  normal  0.0783515 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1144  inositol monophosphatase  41.46 
 
 
267 aa  194  9e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.221581  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>