More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1279 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1279  flagellar biosynthesis protein FlhA  100 
 
 		 715 aa  1407    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2903  flagellar biosynthesis protein FlhA  65.31 
 
 		 707 aa  816    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03147  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.89 
 
 		 699 aa  640    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3430  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.68 
 
 		 705 aa  631  1e-179  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0744  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.94 
 
 		 697 aa  631  1e-179  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1172  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.96 
 
 		 703 aa  625  1e-178  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.167459 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002829  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.59 
 
 		 710 aa  628  1e-178  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.192005  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3052  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.34 
 
 		 700 aa  626  1e-178  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0382146 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1375  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.22 
 
 		 699 aa  623  1e-177  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.361202  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1296  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.56 
 
 		 699 aa  623  1e-177  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1363  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.56 
 
 		 699 aa  623  1e-177  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.960302 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2912  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.72 
 
 		 699 aa  619  1e-176  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1451  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.72 
 
 		 699 aa  619  1e-176  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1340  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.3 
 
 		 699 aa  619  1e-176  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3054  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.72 
 
 		 699 aa  619  1e-176  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.921062  normal  0.080885 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1356  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.27 
 
 		 699 aa  620  1e-176  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.212501 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1516  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.15 
 
 		 700 aa  617  1e-175  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1865  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.14 
 
 		 702 aa  618  1e-175  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.443827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2562  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.42 
 
 		 699 aa  617  1e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2293  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.96 
 
 		 697 aa  617  1e-175  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2922  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.72 
 
 		 699 aa  618  1e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.268541  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1335  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.74 
 
 		 697 aa  618  1e-175  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1632  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.52 
 
 		 699 aa  617  1e-175  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2283  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.08 
 
 		 699 aa  616  1e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1945  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.89 
 
 		 690 aa  614  9.999999999999999e-175  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1664  flagellar biosynthesis protein FlhA  49.71 
 
 		 704 aa  610  1e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.124276  normal  0.030626 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2158  flagellar biosynthesis protein FlhA  49.54 
 
 		 690 aa  610  1e-173  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3033  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.27 
 
 		 700 aa  611  1e-173  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1196  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.88 
 
 		 699 aa  611  1e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1618  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.71 
 
 		 702 aa  608  1e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0469489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1657  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.53 
 
 		 697 aa  612  1e-173  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0357682  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5616  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.22 
 
 		 693 aa  605  1.0000000000000001e-171  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114145  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3213  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.56 
 
 		 699 aa  599  1e-170  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1380  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.75 
 
 		 699 aa  601  1e-170  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.329367 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0034  flagellar biosynthesis protein, FlhA  49.71 
 
 		 704 aa  600  1e-170  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.288255  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3670  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.14 
 
 		 709 aa  602  1e-170  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0982  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.3 
 
 		 706 aa  602  1e-170  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121658 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1978  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.83 
 
 		 724 aa  600  1e-170  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02873  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.55 
 
 		 699 aa  598  1e-169  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.656306  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4344  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.06 
 
 		 709 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.265021 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1560  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.68 
 
 		 709 aa  592  1e-168  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.253962 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3169  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.11 
 
 		 700 aa  595  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2167  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.71 
 
 		 755 aa  594  1e-168  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1523  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.06 
 
 		 748 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.403932  normal  0.346987 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3843  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.96 
 
 		 700 aa  592  1e-167  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1393  flagellar biosynthesis FlhA transmembrane protein  46.42 
 
 		 696 aa  592  1e-167  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.203699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1696  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.96 
 
 		 700 aa  592  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2846  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.96 
 
 		 700 aa  592  1e-167  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0062  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.96 
 
 		 700 aa  592  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3924  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.96 
 
 		 700 aa  592  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.932271  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3129  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.96 
 
 		 700 aa  592  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3093  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.53 
 
 		 694 aa  590  1e-167  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.753258  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0599  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.69 
 
 		 699 aa  591  1e-167  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4413  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.71 
 
 		 693 aa  590  1e-167  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.402008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3820  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.53 
 
 		 694 aa  591  1e-167  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.136206 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3422  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.96 
 
 		 700 aa  592  1e-167  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.545221  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1976  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.96 
 
 		 709 aa  587  1e-166  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0869734  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06205  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.27 
 
 		 684 aa  587  1e-166  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.127059  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3440  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.96 
 
 		 709 aa  587  1e-166  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.520758 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0176  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.28 
 
 		 700 aa  586  1e-166  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0117653  normal  0.17502 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3875  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.32 
 
 		 707 aa  587  1e-166  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.547904  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00961  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.27 
 
 		 684 aa  587  1e-166  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.21205  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1749  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.59 
 
 		 692 aa  584  1.0000000000000001e-165  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1749  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.68 
 
 		 692 aa  582  1.0000000000000001e-165  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0195  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.96 
 
 		 700 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.107813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0131  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.89 
 
 		 700 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2963  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.11 
 
 		 700 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.107248  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0182  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.96 
 
 		 700 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45680  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.02 
 
 		 707 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.589215 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2808  flagellar biosynthesis protein FlhA  49.04 
 
 		 715 aa  585  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18652  normal  0.0746951 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2976  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.33 
 
 		 692 aa  581  1e-164  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4067  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.26 
 
 		 708 aa  582  1e-164  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3707  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.03 
 
 		 693 aa  579  1e-164  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.306788  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4179  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.26 
 
 		 708 aa  582  1e-164  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3803  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.75 
 
 		 700 aa  581  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0250  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.13 
 
 		 700 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.253227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0740  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.26 
 
 		 694 aa  578  1.0000000000000001e-163  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1246  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.12 
 
 		 692 aa  578  1.0000000000000001e-163  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.932165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2015  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.72 
 
 		 695 aa  578  1.0000000000000001e-163  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.372336  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3699  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.24 
 
 		 695 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0172867 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2839  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.13 
 
 		 700 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.753439  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0268  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.13 
 
 		 700 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0416492  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3371  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.98 
 
 		 699 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.029273  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1520  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.28 
 
 		 698 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1863  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.17 
 
 		 693 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.707218  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3913  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.76 
 
 		 709 aa  575  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.11934  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4141  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.05 
 
 		 697 aa  570  1e-161  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.303073  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1548  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.4 
 
 		 698 aa  572  1e-161  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0931  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.09 
 
 		 697 aa  569  1e-161  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1761  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.09 
 
 		 692 aa  568  1e-160  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.98256  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1619  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.68 
 
 		 700 aa  568  1e-160  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.033261 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27910  flagellar biosynthesis protein  45.71 
 
 		 694 aa  557  1e-157  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00371527  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01850  flagellar biosynthesis protein A  45.94 
 
 		 692 aa  551  1e-155  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.585433  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2616  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.94 
 
 		 692 aa  551  1e-155  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000268529 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1753  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.93 
 
 		 692 aa  551  1e-155  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1974  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.95 
 
 		 692 aa  551  1e-155  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1308  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.94 
 
 		 692 aa  551  1e-155  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201196 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2111  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.94 
 
 		 692 aa  551  1e-155  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01839  hypothetical protein  45.94 
 
 		 692 aa  551  1e-155  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.591192  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2431  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.7 
 
 		 692 aa  547  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>