136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0103 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0103  hypothetical protein  100 
 
 		 226 aa  434  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.156412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4421  hypothetical protein  47.03 
 
 		 202 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.752058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1653  hypothetical protein  40.68 
 
 		 217 aa  124  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0326  hypothetical protein  35.39 
 
 		 193 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0131678  normal  0.253093 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5218  hypothetical protein  34.83 
 
 		 193 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5167  hypothetical protein  34.43 
 
 		 193 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1838  hypothetical protein  36.76 
 
 		 187 aa  108  5e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.951981 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02530  hypothetical protein  35.39 
 
 		 193 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000815463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5074  hypothetical protein  33.88 
 
 		 193 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.801454 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0284  hypothetical protein  35.96 
 
 		 193 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.644454  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0298  hypothetical protein  34.97 
 
 		 193 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0646523 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1067  hypothetical protein  39.88 
 
 		 229 aa  106  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.746844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5224  hypothetical protein  33.33 
 
 		 193 aa  104  9e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2518  hypothetical protein  34.81 
 
 		 188 aa  103  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0221  hypothetical protein  34.27 
 
 		 193 aa  102  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1327  hypothetical protein  36.99 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00305825  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1857  hypothetical protein  37.06 
 
 		 187 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0115527  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4343  hypothetical protein  35.08 
 
 		 193 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1908  hypothetical protein  34.09 
 
 		 186 aa  97.1  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2197  hypothetical protein  30.56 
 
 		 181 aa  97.4  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3781  hypothetical protein  33.9 
 
 		 181 aa  95.9  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000225308 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0049  protein of unknown function DUF1234  35.8 
 
 		 180 aa  95.5  6e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.47324  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2503  hypothetical protein  30.05 
 
 		 213 aa  95.1  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.265063  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0049  protein of unknown function DUF1234  33.91 
 
 		 183 aa  95.1  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0030  hypothetical protein  35.8 
 
 		 180 aa  94.4  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.102524 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0834  protein of unknown function DUF1234  28.49 
 
 		 189 aa  94  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.839613  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3178  protein of unknown function DUF1234  31.91 
 
 		 189 aa  94  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0077  hypothetical protein  33.33 
 
 		 179 aa  92.4  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2544  hypothetical protein  33.7 
 
 		 193 aa  92  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.424975  normal  0.0227832 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0055  hypothetical protein  36.26 
 
 		 183 aa  91.7  7e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0052  hypothetical protein  35.82 
 
 		 211 aa  91.7  9e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.646414  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0239  hypothetical protein  35.59 
 
 		 189 aa  89.7  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31700  hypothetical protein  33.71 
 
 		 193 aa  89.7  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1908  hypothetical protein  36.72 
 
 		 202 aa  89.7  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.397068 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1385  hypothetical protein  37.29 
 
 		 182 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231503  normal  0.376399 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1283  protein of unknown function DUF1234  33.79 
 
 		 224 aa  88.6  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0206203  normal  0.287726 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0866  protein of unknown function DUF1234  36.16 
 
 		 203 aa  88.6  7e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.545065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5293  hypothetical protein  33.33 
 
 		 189 aa  88.6  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.11545 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3119  hypothetical protein  36.72 
 
 		 191 aa  87.8  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.204784  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0067  hypothetical protein  33.71 
 
 		 180 aa  88.2  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.39608  normal  0.76446 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3849  hypothetical protein  36.72 
 
 		 191 aa  87.8  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1722  protein of unknown function DUF1234  35.23 
 
 		 183 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1604  hypothetical protein  32.29 
 
 		 189 aa  87.4  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1443  hypothetical protein  34.04 
 
 		 198 aa  86.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1309  hypothetical protein  36 
 
 		 187 aa  87  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5117  hypothetical protein  34.59 
 
 		 204 aa  87.4  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3103  alpha/beta fold family hydrolase  34.04 
 
 		 198 aa  86.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0758  hypothetical protein  35.18 
 
 		 194 aa  87  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55844  normal  0.902939 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4591  hypothetical protein  31.82 
 
 		 216 aa  87  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1069  hypothetical protein  34.04 
 
 		 198 aa  86.7  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1354  hypothetical protein  34.04 
 
 		 198 aa  86.7  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2336  hypothetical protein  34.04 
 
 		 198 aa  86.7  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4455  protein of unknown function DUF1234  32.37 
 
 		 183 aa  86.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.72275 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0925  hypothetical protein  36.16 
 
 		 182 aa  86.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1407  hypothetical protein  36.16 
 
 		 182 aa  86.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0858  alpha/beta fold family hydrolase  30.68 
 
 		 182 aa  85.9  4e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0349348  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1220  protein of unknown function DUF1234  34.25 
 
 		 224 aa  86.3  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.389413  normal  0.138003 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2133  protein of unknown function DUF1234  30 
 
 		 184 aa  85.9  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0928493 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2133  hypothetical protein  31.87 
 
 		 189 aa  85.5  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.436983  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6059  protein of unknown function DUF1234  32.76 
 
 		 177 aa  85.5  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3416  hypothetical protein  28.74 
 
 		 183 aa  85.1  9e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.175516  normal  0.0549661 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0050  hypothetical protein  31.89 
 
 		 186 aa  84.7  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1924  protein of unknown function DUF1234  30.86 
 
 		 184 aa  84.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1495  hypothetical protein  30.11 
 
 		 186 aa  84.3  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.114257 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1542  hypothetical protein  31.79 
 
 		 192 aa  83.6  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2134  hypothetical protein  34.66 
 
 		 183 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.288994 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1283  hypothetical protein  29.71 
 
 		 189 aa  83.2  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1786  hypothetical protein  35.8 
 
 		 183 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.188793 
 
 
-
 
NC_004310  BR0845  hypothetical protein  29.05 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4551  hypothetical protein  36.52 
 
 		 184 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1763  hypothetical protein  29.14 
 
 		 185 aa  82.4  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.152946  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2551  hypothetical protein  36.47 
 
 		 183 aa  82.4  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.863121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0836  hypothetical protein  29.05 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2826  protein of unknown function DUF1234  37.14 
 
 		 186 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0211367 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1284  hypothetical protein  34.86 
 
 		 182 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0197  hypothetical protein  33.71 
 
 		 204 aa  81.6  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1847  hypothetical protein  25.14 
 
 		 182 aa  80.1  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220085  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5573  protein of unknown function DUF1234  32.37 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0201605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2122  protein of unknown function DUF1234  35.23 
 
 		 183 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.640566  normal  0.890414 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3997  protein of unknown function DUF1234  26.86 
 
 		 180 aa  80.1  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0372283  normal  0.379292 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3733  protein of unknown function DUF1234  34.81 
 
 		 182 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4810  protein of unknown function DUF1234  34.81 
 
 		 182 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.077469  normal  0.951292 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2379  hypothetical protein  28.49 
 
 		 188 aa  80.5  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1318  hypothetical protein  34.64 
 
 		 184 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.136684 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1097  protein of unknown function DUF1234  35.71 
 
 		 183 aa  78.6  0.00000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2375  hypothetical protein  29.48 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2962  protein of unknown function DUF1234  32.02 
 
 		 191 aa  78.6  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1344  hypothetical protein  34.29 
 
 		 222 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.900855  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2317  hypothetical protein  33.93 
 
 		 182 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.655444 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4844  hypothetical protein  33.16 
 
 		 191 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00035092  normal  0.0103539 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6816  hypothetical protein  34.13 
 
 		 182 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1375  hypothetical protein  31.31 
 
 		 221 aa  77.4  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0570  esterase  27.59 
 
 		 193 aa  75.9  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0451688 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2842  hypothetical protein  29.35 
 
 		 190 aa  75.9  0.0000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7556  protein of unknown function DUF1234  32.35 
 
 		 182 aa  75.1  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.230494  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1615  hypothetical protein  32.56 
 
 		 183 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.909669  normal  0.797887 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1734  hypothetical protein  30.39 
 
 		 189 aa  74.7  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1608  hypothetical protein  32.64 
 
 		 191 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7179  hypothetical protein  34.38 
 
 		 194 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.618191 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2670  hypothetical protein  34.51 
 
 		 191 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>