106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1509 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1509  translation initiation factor SUI1  100 
 
 		 112 aa  222  1e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.920781  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1695  translation initiation factor SUI1  49.41 
 
 		 119 aa  74.7  0.0000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2075  translation initiation factor SUI1  41.77 
 
 		 98 aa  58.5  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4188  translation initiation factor SUI1  40.32 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3637  translation initiation factor SUI1  37.97 
 
 		 98 aa  55.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1627  translation initiation factor SUI1  38.27 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2419  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  33.66 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1754  translation initiation factor SUI1  36.27 
 
 		 120 aa  53.5  0.0000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.000000113267  hitchhiker  0.00210388 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0584  translation initiation factor SUI1  36.73 
 
 		 120 aa  52.8  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00019387 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1737  translation initiation factor SUI1  44.44 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00084137  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4092  translation initiation factor SUI1  39.44 
 
 		 117 aa  52.8  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1574  translation initiation factor SUI1  35.29 
 
 		 128 aa  51.6  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0438  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  38.27 
 
 		 120 aa  51.6  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1511  translation initiation factor Sui1  42.86 
 
 		 108 aa  51.2  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000972273  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1917  translation initiation factor Sui1  42.86 
 
 		 109 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000003145  hitchhiker  0.00000000000000420932 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01259  translation initiation factor Sui1  34.44 
 
 		 108 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000686676  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2365  translation initiation factor SUI1  34.44 
 
 		 108 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000110904  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1394  translation initiation factor Sui1  34.44 
 
 		 108 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000598621  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1485  translation initiation factor Sui1  34.44 
 
 		 108 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305323  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2646  translation initiation factor Sui1  42.86 
 
 		 108 aa  50.8  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000146872  hitchhiker  0.00000603572 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2344  translation initiation factor Sui1  34.44 
 
 		 108 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000454927  unclonable  0.000000015805 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1846  translation initiation factor Sui1  34.44 
 
 		 109 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000134227  hitchhiker  8.5212e-20 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01270  hypothetical protein  34.44 
 
 		 108 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000544894  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1912  translation initiation factor Sui1  39.68 
 
 		 108 aa  50.8  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000470884  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2237  translation initiation factor Sui1  39.68 
 
 		 108 aa  50.8  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0294222  normal  0.0125302 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2023  translation initiation factor Sui1  39.68 
 
 		 108 aa  50.8  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.785803  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0267  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  35.79 
 
 		 124 aa  50.8  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2099  putative translation initiation factor SUI1  41.94 
 
 		 117 aa  50.4  0.000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1704  translation initiation factor SUI1  41.27 
 
 		 108 aa  50.1  0.000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00246322  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3018  translation initiation factor Sui1  36.51 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000751139  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2680  translation initiation factor Sui1  36.51 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0244604  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3033  translation initiation factor Sui1  36.51 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000199492  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3176  translation initiation factor Sui1  36.51 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00012053  hitchhiker  0.0057416 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01715  Sui1 family protein  38.1 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1345  translation initiation factor Sui1  36.51 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00294429  hitchhiker  0.000000000546863 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4810  translation initiation factor Sui1  39.68 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.61015 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2364  translation initiation factor Sui1  41.27 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0271288  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10953  putative translation initiation factor  31.52 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.788012  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2854  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  35.71 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.339586  normal  0.0877983 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1271  translation initiation factor Sui1  30.77 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000428708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0760  translation initiation factor SUI1  36.59 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1830  translation initiation factor Sui1  30.43 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0277649  hitchhiker  8.595610000000001e-28 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1892  translation initiation factor Sui1  30.43 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.137818  hitchhiker  0.0000000000000626787 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1835  translation initiation factor Sui1  30.43 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00136333  hitchhiker  0.000244384 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0413  translation initiation factor Sui1  30.43 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.205181  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1443  translation initiation factor Sui1  30.43 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000185964  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1625  translation initiation factor Sui1  30.43 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00194965  hitchhiker  4.78145e-19 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2865  translation initiation factor SUI1  43.75 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2639  translation initiation factor Sui1  39.68 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000116235  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0972  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  34.92 
 
 		 105 aa  47.8  0.00005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000017895  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1200  translation initiation factor Sui1  30.77 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000764802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4512  translation initiation factor SUI1  29.67 
 
 		 112 aa  48.1  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.477068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27071  translation initiation factor SUI1  39.06 
 
 		 113 aa  47.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2203  translation initiation factor SUI1  35.06 
 
 		 114 aa  47.4  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.513989 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3343  translation initiation factor Sui1  38.81 
 
 		 122 aa  47.4  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2838  translation initiation factor SUI1  35.87 
 
 		 110 aa  47  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.179746  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3345  translation initiation factor Sui1  31.87 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1532  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  32 
 
 		 107 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2675  translation initiation factor Sui1  32.14 
 
 		 121 aa  46.2  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000045449  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1201  translation initiation factor Sui1  30.77 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0177618  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02391  translation initiation factor SUI1  32 
 
 		 107 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2186  translation initiation factor Sui1  38.1 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.019439  hitchhiker  0.000338309 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1338  translation initiation factor Sui1  38.1 
 
 		 109 aa  46.2  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0446445  hitchhiker  0.000386966 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3154  translation initiation factor Sui1  28.43 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0471  translation initiation factor SUI1  35.8 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2964  translation initiation factor Sui1  28.43 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.650467 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1163  translation initiation factor SUI1  34.92 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0953729  normal  0.11202 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1443  translation initiation factor SUI1  38.1 
 
 		 125 aa  46.2  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00199904  normal  0.134693 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05783  translation initiation factor Sui1  38.1 
 
 		 103 aa  45.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3853  translation initiation factor SUI1  28.57 
 
 		 123 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0413  translation initiation factor Sui1  32.94 
 
 		 122 aa  44.7  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1504  translation initiation factor SUI1  35.21 
 
 		 107 aa  44.7  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000152  translation initiation factor SUI1-related protein  38.1 
 
 		 103 aa  45.1  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0210  translation initiation factor SUI1  31.82 
 
 		 98 aa  44.3  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0343  translation initiation factor Sui1  35.21 
 
 		 121 aa  44.7  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000865275  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1238  translation initiation factor Sui1  36.51 
 
 		 109 aa  44.3  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.120876 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1592  translation initiation factor SUI1  29.27 
 
 		 106 aa  44.3  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1185  translation initiation factor SUI1  30.11 
 
 		 114 aa  43.9  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00309802  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1423  translation initiation factor SUI1  37.5 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0248  translation initation factor SUI1, putative  34.88 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1910  translation initiation factor Sui1  42.86 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.101558 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2851  translation initiation factor Sui1  36.51 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.181646  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2195  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  35.94 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0976146  normal  0.851363 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1145  translation initiation factor Sui1  36.51 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.244875  normal  0.0321513 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0513  translation initiation factor Sui1  41.43 
 
 		 126 aa  42.7  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.435578  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3941  translation initiation factor SUI1  34.57 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0627  translation initiation factor Sui1  34.38 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.344568  normal  0.0369514 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0366  translation initiation factor Sui1  39.74 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.485747  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5560  translation initiation factor Sui1  31.37 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2580  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  39.68 
 
 		 107 aa  42  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64000  translation initiation factor Sui1  30.39 
 
 		 123 aa  41.6  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3188  translation initiation factor SUI1  33.33 
 
 		 118 aa  42  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00588203  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0605  translation initiation factor SUI1  37.5 
 
 		 184 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1133  translation initiation factor Sui1  34.92 
 
 		 109 aa  42  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.129077  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0566  translation initiation factor Sui1  37.5 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0611  translation initiation factor Sui1  37.5 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0649934 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4599  translation initiation factor Sui1  37.5 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.062909 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2471  translation initiation factor Sui1  36.51 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.827071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2059  translation initiation factor SUI1  40.91 
 
 		 120 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2534  translation initiation factor Sui1  32.81 
 
 		 97 aa  41.2  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>