19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0542 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0542  DNA polymerase III subunit delta  100 
 
 		 320 aa  650    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0864  DNA polymerase III delta  37.46 
 
 		 328 aa  216  4e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1999  DNA polymerase III subunit delta  35.89 
 
 		 332 aa  186  3e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.414125  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1584  DNA polymerase III subunit delta  32.52 
 
 		 332 aa  181  1e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1130  DNA polymerase III subunit delta  31.08 
 
 		 337 aa  161  1e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1369  DNA polymerase III subunit delta  32.92 
 
 		 321 aa  152  7e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.512363  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0950  DNA polymerase III subunit delta  32.72 
 
 		 321 aa  148  1.0000000000000001e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.36391  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0733  DNA polymerase III subunit delta  31.38 
 
 		 321 aa  144  2e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.886235  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0658  DNA polymerase III subunit delta  30.46 
 
 		 322 aa  139  4.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0371  DNA polymerase III subunit delta  28.35 
 
 		 328 aa  125  1e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4260  DNA polymerase III, delta subunit  27.45 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  19.63 
 
 		 332 aa  54.7  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2007  DNA polymerase III, delta subunit  23.81 
 
 		 336 aa  53.9  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0773552  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2356  DNA polymerase III, delta subunit  24.62 
 
 		 374 aa  47.8  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1587  DNA polymerase III, delta subunit  21.14 
 
 		 333 aa  46.2  0.0006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1278  DNA polymerase III subunit delta  28.57 
 
 		 347 aa  46.2  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  19.69 
 
 		 329 aa  45.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0179  DNA polymerase III, delta subunit  25.82 
 
 		 331 aa  44.3  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0323  AAA ATPase central domain protein  28.83 
 
 		 458 aa  43.9  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>