12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_0658 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_0658  DNA polymerase III subunit delta  100 
 
 
322 aa  629  1e-179  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0733  DNA polymerase III subunit delta  98.12 
 
 
321 aa  611  9.999999999999999e-175  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.886235  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1369  DNA polymerase III subunit delta  95.31 
 
 
321 aa  600  1e-170  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.512363  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0950  DNA polymerase III subunit delta  63.12 
 
 
321 aa  415  9.999999999999999e-116  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.36391  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1130  DNA polymerase III subunit delta  43.52 
 
 
337 aa  259  3e-68  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1584  DNA polymerase III subunit delta  42.02 
 
 
332 aa  254  2.0000000000000002e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1999  DNA polymerase III subunit delta  40.8 
 
 
332 aa  236  3e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.414125  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0371  DNA polymerase III subunit delta  35.47 
 
 
328 aa  181  1e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0864  DNA polymerase III delta  34.35 
 
 
328 aa  179  4.999999999999999e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0542  DNA polymerase III subunit delta  30.46 
 
 
320 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1378  DNA polymerase III subunit delta  22.97 
 
 
343 aa  43.5  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.212433  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1311  DNA polymerase III subunit delta  22.97 
 
 
343 aa  43.5  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>