10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1130 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1130  DNA polymerase III subunit delta  100 
 
 
337 aa  666    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1584  DNA polymerase III subunit delta  51.68 
 
 
332 aa  353  2e-96  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1999  DNA polymerase III subunit delta  53.96 
 
 
332 aa  353  2.9999999999999997e-96  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.414125  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1369  DNA polymerase III subunit delta  43.83 
 
 
321 aa  262  6.999999999999999e-69  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.512363  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0733  DNA polymerase III subunit delta  43.83 
 
 
321 aa  261  1e-68  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.886235  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0658  DNA polymerase III subunit delta  43.52 
 
 
322 aa  259  3e-68  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0950  DNA polymerase III subunit delta  41.36 
 
 
321 aa  247  2e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.36391  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0371  DNA polymerase III subunit delta  40.43 
 
 
328 aa  235  7e-61  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0864  DNA polymerase III delta  36.78 
 
 
328 aa  200  3.9999999999999996e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0542  DNA polymerase III subunit delta  30.86 
 
 
320 aa  159  7e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>