13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_1369 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009707  JJD26997_1369  DNA polymerase III subunit delta  100 
 
 
321 aa  629  1e-179  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.512363  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0733  DNA polymerase III subunit delta  95.02 
 
 
321 aa  601  1.0000000000000001e-171  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.886235  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0658  DNA polymerase III subunit delta  95.31 
 
 
322 aa  600  1e-170  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0950  DNA polymerase III subunit delta  63.55 
 
 
321 aa  421  1e-117  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.36391  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1130  DNA polymerase III subunit delta  43.83 
 
 
337 aa  262  6.999999999999999e-69  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1584  DNA polymerase III subunit delta  41.41 
 
 
332 aa  253  4.0000000000000004e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1999  DNA polymerase III subunit delta  41.1 
 
 
332 aa  239  2.9999999999999997e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.414125  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0371  DNA polymerase III subunit delta  34.97 
 
 
328 aa  184  1.0000000000000001e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0864  DNA polymerase III delta  34.65 
 
 
328 aa  183  3e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0542  DNA polymerase III subunit delta  32.92 
 
 
320 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4959  DNA polymerase III subunit delta  25 
 
 
345 aa  45.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08980  DNA polymerase III subunit delta  28.33 
 
 
346 aa  44.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0881789  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2746  DNA polymerase III, delta subunit  26.97 
 
 
337 aa  43.1  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>