17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0950 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0950  DNA polymerase III subunit delta  100 
 
 		 321 aa  628  1e-179  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.36391  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1369  DNA polymerase III subunit delta  63.55 
 
 		 321 aa  421  1e-117  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.512363  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0733  DNA polymerase III subunit delta  63.24 
 
 		 321 aa  414  9.999999999999999e-116  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.886235  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0658  DNA polymerase III subunit delta  63.12 
 
 		 322 aa  415  9.999999999999999e-116  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1584  DNA polymerase III subunit delta  41.46 
 
 		 332 aa  255  7e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1999  DNA polymerase III subunit delta  43.6 
 
 		 332 aa  255  8e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.414125  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1130  DNA polymerase III subunit delta  41.36 
 
 		 337 aa  247  2e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0371  DNA polymerase III subunit delta  36.7 
 
 		 328 aa  187  3e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0864  DNA polymerase III delta  34.35 
 
 		 328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0542  DNA polymerase III subunit delta  32.72 
 
 		 320 aa  143  3e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1311  DNA polymerase III subunit delta  24.71 
 
 		 343 aa  50.8  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1378  DNA polymerase III subunit delta  24.71 
 
 		 343 aa  50.4  0.00004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.212433  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2917  DNA polymerase III, delta subunit  26.11 
 
 		 342 aa  48.5  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  20.14 
 
 		 336 aa  45.8  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2910  DNA polymerase III subunit delta  22.97 
 
 		 345 aa  44.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01220  DNA polymerase III subunit delta  21.74 
 
 		 339 aa  42.7  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004219  DNA polymerase III delta subunit  22.56 
 
 		 339 aa  42.7  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00302346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>