10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1584 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1584  DNA polymerase III subunit delta  100 
 
 
332 aa  664    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1999  DNA polymerase III subunit delta  70.18 
 
 
332 aa  482  1e-135  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.414125  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1130  DNA polymerase III subunit delta  51.68 
 
 
337 aa  353  2e-96  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0950  DNA polymerase III subunit delta  41.46 
 
 
321 aa  255  8e-67  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.36391  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0658  DNA polymerase III subunit delta  42.02 
 
 
322 aa  254  2.0000000000000002e-66  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0733  DNA polymerase III subunit delta  41.46 
 
 
321 aa  253  4.0000000000000004e-66  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.886235  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1369  DNA polymerase III subunit delta  41.41 
 
 
321 aa  253  4.0000000000000004e-66  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.512363  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0371  DNA polymerase III subunit delta  42.55 
 
 
328 aa  241  2e-62  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0864  DNA polymerase III delta  37.2 
 
 
328 aa  211  2e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0542  DNA polymerase III subunit delta  32.52 
 
 
320 aa  176  5e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>