218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3042 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3042  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
204 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.953695 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3268  NADPH-dependent FMN reductase  82.61 
 
 
209 aa  345  2e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.73404  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0225  NADPH-dependent FMN reductase  56.91 
 
 
188 aa  204  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3471  NADPH-dependent FMN reductase  55.26 
 
 
239 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.155268 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1286  NADPH-dependent FMN reductase  53.65 
 
 
254 aa  198  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.138321  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0965  NADPH-dependent FMN reductase family protein  57.69 
 
 
220 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0451  NADPH-dependent FMN reductase family protein  56.59 
 
 
220 aa  194  9e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3780  NADPH-dependent FMN reductase  52.43 
 
 
193 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3711  NADPH-dependent FMN reductase  50.84 
 
 
202 aa  194  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0350299  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3853  NADPH-dependent FMN reductase  52.43 
 
 
193 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.201053  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3784  NADPH-dependent FMN reductase  52.43 
 
 
193 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0598804  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1934  NADPH-dependent FMN reductase  56.59 
 
 
216 aa  193  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2029  NADPH-dependent FMN reductase  56.59 
 
 
216 aa  193  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1873  NADPH-dependent FMN reductase family protein  56.59 
 
 
216 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0563  NADPH-dependent FMN reductase family protein  56.59 
 
 
423 aa  192  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.50284  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5706  NADPH-dependent FMN reductase  54.4 
 
 
219 aa  192  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.311167  normal  0.729619 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0904  NADPH-dependent FMN reductase family protein  56.04 
 
 
216 aa  191  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1014  NADPH-dependent FMN reductase family protein  54.95 
 
 
248 aa  190  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.065516 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2407  NADPH-dependent FMN reductase  50.81 
 
 
199 aa  189  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3454  NADPH-dependent FMN reductase  56.99 
 
 
254 aa  189  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.742849  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3481  NADPH-dependent FMN reductase  55.49 
 
 
283 aa  188  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.236769 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3190  NADPH-dependent FMN reductase  55.49 
 
 
285 aa  187  7e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5177  NADPH-dependent FMN reductase  55.49 
 
 
285 aa  187  7e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0196173 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5102  NADPH-dependent FMN reductase  55.49 
 
 
216 aa  187  7e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5096  NADPH-dependent FMN reductase  55.49 
 
 
216 aa  186  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.332097 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4572  NADPH-dependent FMN reductase  55.49 
 
 
285 aa  186  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4239  NADPH-dependent FMN reductase  51.37 
 
 
197 aa  186  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36310  predicted flavoprotein  55.49 
 
 
199 aa  181  7e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0700  NADPH-dependent FMN reductase  51.41 
 
 
189 aa  169  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1658  NADPH-dependent FMN reductase  47.87 
 
 
191 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0411854  normal  0.745478 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2460  NADPH-dependent FMN reductase  39.11 
 
 
184 aa  121  6e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.345085  normal  0.908129 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1148  NADPH-dependent FMN reductase  35.29 
 
 
183 aa  98.6  5e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.148322  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2933  NADPH-dependent FMN reductase  33.71 
 
 
192 aa  96.3  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.89226  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2123  NADPH-dependent FMN reductase  33.52 
 
 
195 aa  94  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2443  NADPH-dependent FMN reductase  29.14 
 
 
181 aa  89.7  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000556188  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3596  NADPH-dependent FMN reductase  27.84 
 
 
182 aa  89.4  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0041425 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2199  NADPH-dependent FMN reductase  33.52 
 
 
192 aa  88.2  7e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3750  NADPH-dependent FMN reductase  33.68 
 
 
199 aa  86.7  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3252  NADPH-dependent FMN reductase  30.29 
 
 
192 aa  85.9  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.399467  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5221  NADPH-dependent FMN reductase  26.29 
 
 
181 aa  85.5  5e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.681461  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1275  NADPH-dependent FMN reductase  33.15 
 
 
192 aa  84.7  9e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3996  NADPH-dependent FMN reductase  30.34 
 
 
188 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.938741  hitchhiker  0.00000030757 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1182  NADPH-dependent FMN reductase  27.27 
 
 
178 aa  80.5  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1209  NADPH-dependent FMN reductase  27.27 
 
 
178 aa  80.5  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.398718  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1954  NADPH-dependent FMN reductase  32.81 
 
 
197 aa  79.7  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.867559  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3357  NADPH-dependent FMN reductase  27.43 
 
 
193 aa  77.8  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0315323  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2656  NADPH-dependent FMN reductase  29.78 
 
 
179 aa  61.6  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0206  azoreductase  30.36 
 
 
188 aa  60.1  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.525066  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0583  hypothetical protein  31.25 
 
 
188 aa  60.5  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.600123  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0597  hypothetical protein  31.25 
 
 
188 aa  60.5  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2397  NADPH-dependent FMN reductase  23.23 
 
 
229 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00855962 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02783  redicted flavoprotein  25.82 
 
 
188 aa  58.5  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690393  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5053  arsenate resistance ArsH  23.46 
 
 
251 aa  57.4  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1520  NADPH-dependent FMN reductase  24.26 
 
 
240 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.85919  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3362  arsenical resistance protein ArsH  25.58 
 
 
216 aa  55.1  0.0000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.793551  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1978  arsenical resistance protein ArsH  25.14 
 
 
246 aa  55.1  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.288528  normal  0.218001 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1927  arsenical resistance protein ArsH, putative  22.73 
 
 
241 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.329058  unclonable  0.0000003087 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  28.91 
 
 
193 aa  54.7  0.0000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  29.41 
 
 
194 aa  54.7  0.0000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2241  arsenate resistance ArsH  25.81 
 
 
248 aa  53.9  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.192404  normal  0.613999 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2136  arsenical resistance protein ArsH  23.46 
 
 
251 aa  53.5  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2220  NADPH-dependent FMN reductase  24.02 
 
 
237 aa  53.5  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.295954  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3080  arsenical resistance protein ArsH  25.27 
 
 
233 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.226579  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2961  arsenical resistance protein ArsH  24.02 
 
 
230 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  28.12 
 
 
193 aa  53.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2096  azobenzene reductase  30.14 
 
 
178 aa  53.1  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0284733  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3778  arsenical resistance protein ArsH, putative  24.02 
 
 
234 aa  52.8  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  28.91 
 
 
193 aa  53.1  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2386  azoreductase  31.13 
 
 
178 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3037  arsenate resistance ArsH  24.86 
 
 
233 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.317607  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2715  arsH protein  24.86 
 
 
233 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.74454  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0716  arsenical resistance protein ArsH  23.53 
 
 
232 aa  52.8  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.075444 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1668  azobenzene reductase  33.64 
 
 
178 aa  52.8  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2259  azoreductase  31.13 
 
 
178 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5149  arsenical resistance protein ArsH  24.26 
 
 
238 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.135921  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3066  azoreductase  31.13 
 
 
178 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2056  azoreductase ( NAD(P)H oxidoreductase, quinone reductase )  32.08 
 
 
178 aa  52  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1132  hypothetical protein  29.17 
 
 
212 aa  52  0.000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2310  azoreductase  32.08 
 
 
179 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.702721  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1960  arsenical resistance protein ArsH  23.28 
 
 
246 aa  51.6  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0764364  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4428  NADPH-dependent FMN reductase  24.02 
 
 
240 aa  51.6  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35080  putative arsenical resistance protein  24.58 
 
 
230 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1184  NADPH-dependent FMN reductase  32.84 
 
 
223 aa  50.8  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal  0.152042 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2122  azoreductase  32.08 
 
 
178 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.120348  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2060  azoreductase ( NAD(P)H oxidoreductase, quinone reductase )  32.08 
 
 
178 aa  51.2  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3864  NADPH-dependent FMN reductase  32.69 
 
 
190 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2276  azoreductase  32.08 
 
 
178 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.39855  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5403  NADPH-dependent FMN reductase  42.31 
 
 
190 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1062  NADPH-dependent FMN reductase  26.83 
 
 
201 aa  51.2  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2302  azoreductase  32.08 
 
 
178 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00698178 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2452  NADPH-dependent FMN reductase  44.23 
 
 
190 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2537  NADPH-dependent FMN reductase  23.73 
 
 
247 aa  50.4  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3396  NADPH-dependent FMN reductase  21.79 
 
 
244 aa  50.4  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.56514  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3610  arsenical resistance protein ArsH  25.89 
 
 
211 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.404184 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2010  NADPH-dependent FMN reductase  29.17 
 
 
207 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000015054  normal  0.204616 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4706  NADPH-dependent FMN reductase  31.82 
 
 
190 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.781417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3657  NADPH-dependent FMN reductase  31.82 
 
 
190 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0164718  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1141  arsenate resistance ArsH  24.62 
 
 
249 aa  50.1  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.370574  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3305  iron-sulfur flavoprotein  29.79 
 
 
222 aa  49.3  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.328284  normal  0.134625 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2190  NADPH-dependent FMN reductase  30.71 
 
 
189 aa  49.3  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>