16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3750 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3750  serine protease  100 
 
 		 315 aa  650    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0981  hypothetical protein  28.23 
 
 		 319 aa  92  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.411315 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0921  hypothetical protein  28.7 
 
 		 319 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.906355 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0945  hypothetical protein  27.63 
 
 		 319 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.790571  normal  0.830794 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5196  V8-like protein Glu-specific endopeptidase-like protein  26.85 
 
 		 694 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.710887  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01407  serine peptidase  33.57 
 
 		 604 aa  68.6  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.210729  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0154  hypothetical protein  26.56 
 
 		 312 aa  62  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3643  hypothetical protein  26.87 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.370129 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3597  hypothetical protein  29.94 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.713823 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1602  hypothetical protein  31.88 
 
 		 334 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000664087 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3225  hypothetical protein  30.77 
 
 		 277 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3724  hypothetical protein  31.5 
 
 		 290 aa  53.9  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.175481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0899  V8-like Glu-specific endopeptidase  35.29 
 
 		 677 aa  53.1  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1058  hypothetical protein  37.66 
 
 		 290 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.971814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6920  hypothetical protein  29.31 
 
 		 256 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0000215258  hitchhiker  0.000122143 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4089  V8-like Glu-specific endopeptidase  24.6 
 
 		 296 aa  43.1  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.355877 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>