21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01407 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01407  serine peptidase  100 
 
 		 604 aa  1214    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.210729  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0154  hypothetical protein  27.36 
 
 		 312 aa  75.5  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3750  serine protease  33.57 
 
 		 315 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4089  V8-like Glu-specific endopeptidase  32.53 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0945  hypothetical protein  33.95 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.790571  normal  0.830794 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0981  hypothetical protein  33.95 
 
 		 319 aa  63.9  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.411315 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1058  hypothetical protein  35.2 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.971814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3724  hypothetical protein  35.38 
 
 		 290 aa  63.5  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.175481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0534  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.25 
 
 		 698 aa  62  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.709674  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0921  hypothetical protein  33.82 
 
 		 319 aa  60.5  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.906355 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3225  hypothetical protein  33.58 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0593  hypothetical protein  32.8 
 
 		 294 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.100868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3597  hypothetical protein  38.55 
 
 		 273 aa  54.7  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.713823 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1602  hypothetical protein  33.06 
 
 		 334 aa  53.9  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000664087 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5196  V8-like protein Glu-specific endopeptidase-like protein  31.94 
 
 		 694 aa  48.5  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.710887  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8183  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  32.04 
 
 		 1239 aa  48.1  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.574663  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3643  hypothetical protein  30.77 
 
 		 291 aa  48.1  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.370129 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6920  hypothetical protein  33.68 
 
 		 256 aa  47  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0000215258  hitchhiker  0.000122143 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0899  V8-like Glu-specific endopeptidase  31.78 
 
 		 677 aa  45.4  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0393  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.87 
 
 		 660 aa  45.1  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.13824 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2930  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.43 
 
 		 453 aa  43.5  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>