18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0981 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0981  hypothetical protein  100 
 
 		 319 aa  644    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.411315 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0945  hypothetical protein  97.49 
 
 		 319 aa  632  1e-180  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.790571  normal  0.830794 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0921  hypothetical protein  85.58 
 
 		 319 aa  545  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.906355 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1602  hypothetical protein  62.63 
 
 		 334 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000664087 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0154  hypothetical protein  51.71 
 
 		 312 aa  290  3e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1058  hypothetical protein  54.39 
 
 		 290 aa  282  5.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.971814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3750  serine protease  28.23 
 
 		 315 aa  92  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0899  V8-like Glu-specific endopeptidase  31.1 
 
 		 677 aa  76.3  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3724  hypothetical protein  34.62 
 
 		 290 aa  67  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.175481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01407  serine peptidase  33.95 
 
 		 604 aa  63.9  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.210729  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4089  V8-like Glu-specific endopeptidase  27.85 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5196  V8-like protein Glu-specific endopeptidase-like protein  28.42 
 
 		 694 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.710887  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3643  hypothetical protein  32.37 
 
 		 291 aa  57  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.370129 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2448  hypothetical protein  22.94 
 
 		 257 aa  52.8  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000261989  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0593  hypothetical protein  26.06 
 
 		 294 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.100868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3597  hypothetical protein  25.95 
 
 		 273 aa  47.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.713823 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3225  hypothetical protein  35.71 
 
 		 277 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1041  protein of unknown function DUF900 hydrolase family protein  31.64 
 
 		 405 aa  42.7  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0813673 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>