17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0154 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0154  hypothetical protein  100 
 
 		 312 aa  624  1e-178  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1058  hypothetical protein  76.84 
 
 		 290 aa  425  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.971814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0945  hypothetical protein  52.05 
 
 		 319 aa  293  2e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.790571  normal  0.830794 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0981  hypothetical protein  51.71 
 
 		 319 aa  290  3e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.411315 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0921  hypothetical protein  51.24 
 
 		 319 aa  281  1e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.906355 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1602  hypothetical protein  52.33 
 
 		 334 aa  257  1e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000664087 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01407  serine peptidase  27.36 
 
 		 604 aa  75.5  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.210729  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3750  serine protease  26.56 
 
 		 315 aa  62  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3643  hypothetical protein  40.16 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.370129 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3724  hypothetical protein  35.43 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.175481  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4089  V8-like Glu-specific endopeptidase  35.71 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3225  hypothetical protein  34.13 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0899  V8-like Glu-specific endopeptidase  30.56 
 
 		 677 aa  52.8  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3597  hypothetical protein  32.31 
 
 		 273 aa  52  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.713823 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5196  V8-like protein Glu-specific endopeptidase-like protein  34.33 
 
 		 694 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.710887  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0593  hypothetical protein  29.37 
 
 		 294 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.100868  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3171  hypothetical protein  31.62 
 
 		 539 aa  43.1  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>