18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3225 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3225  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  566  1e-160  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3597  hypothetical protein  32.36 
 
 		 273 aa  92  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.713823 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3643  hypothetical protein  42.4 
 
 		 291 aa  82.4  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.370129 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0593  hypothetical protein  25.41 
 
 		 294 aa  65.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.100868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3724  hypothetical protein  33.77 
 
 		 290 aa  63.5  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.175481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6920  hypothetical protein  36.31 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0000215258  hitchhiker  0.000122143 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0899  V8-like Glu-specific endopeptidase  32.12 
 
 		 677 aa  60.8  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0154  hypothetical protein  33.56 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3750  serine protease  27.03 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01407  serine peptidase  32.35 
 
 		 604 aa  59.3  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.210729  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1058  hypothetical protein  34.92 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.971814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5196  V8-like protein Glu-specific endopeptidase-like protein  31.02 
 
 		 694 aa  56.6  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.710887  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4089  V8-like Glu-specific endopeptidase  33.6 
 
 		 296 aa  55.5  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0921  hypothetical protein  38.1 
 
 		 319 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.906355 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0981  hypothetical protein  33.66 
 
 		 319 aa  45.4  0.0009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.411315 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0945  hypothetical protein  33.66 
 
 		 319 aa  45.4  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.790571  normal  0.830794 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1482  hypothetical protein  28.08 
 
 		 289 aa  44.3  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000729144 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2759  hypothetical protein  30 
 
 		 289 aa  43.9  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.903799  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>