16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3597 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3597  hypothetical protein  100 
 
 
273 aa  552  1e-156  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.713823 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3225  hypothetical protein  31.14 
 
 
277 aa  93.6  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3724  hypothetical protein  40 
 
 
290 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.175481  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0899  V8-like Glu-specific endopeptidase  32.82 
 
 
677 aa  71.2  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4089  V8-like Glu-specific endopeptidase  33.56 
 
 
296 aa  62  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3643  hypothetical protein  34.62 
 
 
291 aa  61.6  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.370129 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0593  hypothetical protein  32.79 
 
 
294 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.100868  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3750  serine protease  29.94 
 
 
315 aa  56.6  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1058  hypothetical protein  35.71 
 
 
290 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.971814  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01407  serine peptidase  38.55 
 
 
604 aa  54.7  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.210729  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6920  hypothetical protein  29.13 
 
 
256 aa  53.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0000215258  hitchhiker  0.000122143 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0154  hypothetical protein  32.31 
 
 
312 aa  52  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0945  hypothetical protein  29.3 
 
 
319 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.790571  normal  0.830794 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5196  V8-like protein Glu-specific endopeptidase-like protein  27.85 
 
 
694 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.710887  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0921  hypothetical protein  29.81 
 
 
319 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.906355 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0981  hypothetical protein  25.95 
 
 
319 aa  47  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.411315 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>