17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3724 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3724  hypothetical protein  100 
 
 		 290 aa  588  1e-167  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.175481  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4089  V8-like Glu-specific endopeptidase  28.38 
 
 		 296 aa  103  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0593  hypothetical protein  27.15 
 
 		 294 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.100868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0899  V8-like Glu-specific endopeptidase  27.69 
 
 		 677 aa  78.2  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3597  hypothetical protein  40 
 
 		 273 aa  75.9  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.713823 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0981  hypothetical protein  34.62 
 
 		 319 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.411315 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1058  hypothetical protein  39.22 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.971814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5196  V8-like protein Glu-specific endopeptidase-like protein  27.21 
 
 		 694 aa  66.2  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.710887  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0945  hypothetical protein  32.56 
 
 		 319 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.790571  normal  0.830794 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0921  hypothetical protein  36.13 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.906355 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01407  serine peptidase  35.38 
 
 		 604 aa  63.5  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.210729  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3643  hypothetical protein  28.72 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.370129 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0154  hypothetical protein  35.43 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3750  serine protease  25.65 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3225  hypothetical protein  33.33 
 
 		 277 aa  58.9  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1602  hypothetical protein  33.33 
 
 		 334 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000664087 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6920  hypothetical protein  31.2 
 
 		 256 aa  46.2  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0000215258  hitchhiker  0.000122143 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>