24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3599 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3599  hypothetical protein  100 
 
 		 460 aa  941    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.792051  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2704  hypothetical protein  49.27 
 
 		 487 aa  465  9.999999999999999e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.788848  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003105  ubiquitin-protein ligase  54.09 
 
 		 326 aa  181  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000640015  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02737  hypothetical protein  54.72 
 
 		 326 aa  181  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0870  putative lipoprotein  55.35 
 
 		 299 aa  178  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000878798  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1775  hypothetical protein  48.85 
 
 		 304 aa  176  8e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1027  hypothetical protein  34.26 
 
 		 231 aa  123  7e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0489  hypothetical protein  37.31 
 
 		 510 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0522  hypothetical protein  35.07 
 
 		 517 aa  61.6  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0517  hypothetical protein  35.07 
 
 		 517 aa  61.6  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.269944  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  35.4 
 
 		 420 aa  61.2  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0855  hypothetical protein  27.49 
 
 		 546 aa  57.8  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1790  hypothetical protein  26.01 
 
 		 494 aa  57.4  0.0000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3391  hypothetical protein  32.43 
 
 		 534 aa  57.4  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000869188  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3575  hypothetical protein  34.09 
 
 		 522 aa  57  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.774186  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3644  hypothetical protein  34.09 
 
 		 523 aa  57  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3491  hypothetical protein  34.09 
 
 		 529 aa  57  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2476  hypothetical protein  29.8 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.324767 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3081  hypothetical protein  32.59 
 
 		 524 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1184  hypothetical protein  34.48 
 
 		 541 aa  52  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.984742 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2056  hypothetical protein  29.63 
 
 		 449 aa  52.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0032  hypothetical protein  23.83 
 
 		 496 aa  48.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0534564  normal  0.101968 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0365  OmpA domain-containing protein  28.42 
 
 		 181 aa  44.3  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0769021  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0366  OmpA/MotB domain-containing protein  29.17 
 
 		 359 aa  43.5  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193162  normal  0.220878 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>