20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1184 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1184  hypothetical protein  100 
 
 		 541 aa  1112    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.984742 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1123  hypothetical protein  26.82 
 
 		 551 aa  107  7e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.375546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0489  hypothetical protein  44.58 
 
 		 510 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0522  hypothetical protein  42.35 
 
 		 517 aa  63.9  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0517  hypothetical protein  42.35 
 
 		 517 aa  63.9  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.269944  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3575  hypothetical protein  42.05 
 
 		 522 aa  61.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.774186  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3491  hypothetical protein  42.05 
 
 		 529 aa  61.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3644  hypothetical protein  37.19 
 
 		 523 aa  61.6  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2056  hypothetical protein  36.05 
 
 		 449 aa  60.8  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0032  hypothetical protein  37.78 
 
 		 496 aa  60.8  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0534564  normal  0.101968 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3081  hypothetical protein  37.93 
 
 		 524 aa  60.1  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0855  hypothetical protein  35 
 
 		 546 aa  58.2  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3391  hypothetical protein  34.78 
 
 		 534 aa  57.4  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000869188  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0870  putative lipoprotein  34.43 
 
 		 299 aa  57  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000878798  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1790  hypothetical protein  35.71 
 
 		 494 aa  55.5  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1775  hypothetical protein  39.18 
 
 		 304 aa  53.9  0.000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3599  hypothetical protein  34.48 
 
 		 460 aa  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.792051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003105  ubiquitin-protein ligase  27.63 
 
 		 326 aa  45.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000640015  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02737  hypothetical protein  30.52 
 
 		 326 aa  45.4  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1027  hypothetical protein  42.03 
 
 		 231 aa  43.9  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>