19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2056 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2056  hypothetical protein  100 
 
 		 449 aa  921    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1790  hypothetical protein  31.84 
 
 		 494 aa  170  5e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0489  hypothetical protein  30.77 
 
 		 510 aa  121  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0522  hypothetical protein  29.82 
 
 		 517 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0517  hypothetical protein  29.82 
 
 		 517 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.269944  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3491  hypothetical protein  30.2 
 
 		 529 aa  114  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3644  hypothetical protein  30.81 
 
 		 523 aa  113  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3081  hypothetical protein  27.37 
 
 		 524 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3575  hypothetical protein  38.29 
 
 		 522 aa  110  5e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.774186  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3391  hypothetical protein  24.93 
 
 		 534 aa  99.4  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000869188  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0032  hypothetical protein  26.69 
 
 		 496 aa  97.8  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0534564  normal  0.101968 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0855  hypothetical protein  26.38 
 
 		 546 aa  92.4  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1184  hypothetical protein  36.05 
 
 		 541 aa  60.8  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.984742 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3599  hypothetical protein  29.63 
 
 		 460 aa  52.4  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.792051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003105  ubiquitin-protein ligase  30.33 
 
 		 326 aa  50.1  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000640015  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02737  hypothetical protein  29.51 
 
 		 326 aa  48.5  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2704  hypothetical protein  27.74 
 
 		 487 aa  48.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.788848  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0870  putative lipoprotein  26.71 
 
 		 299 aa  47.4  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000878798  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5946  hypothetical protein  24.54 
 
 		 578 aa  47  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>