21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0517 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_0489  hypothetical protein  86.6 
 
 
510 aa  830    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0522  hypothetical protein  99.03 
 
 
517 aa  999    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0517  hypothetical protein  100 
 
 
517 aa  1011    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.269944  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3491  hypothetical protein  48.43 
 
 
529 aa  349  7e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3575  hypothetical protein  46.8 
 
 
522 aa  345  1e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.774186  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3644  hypothetical protein  46.8 
 
 
523 aa  343  4e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3081  hypothetical protein  45.85 
 
 
524 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0855  hypothetical protein  33.26 
 
 
546 aa  203  5e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3391  hypothetical protein  34.56 
 
 
534 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000869188  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0032  hypothetical protein  36 
 
 
496 aa  200  6e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0534564  normal  0.101968 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2056  hypothetical protein  29.82 
 
 
449 aa  115  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1790  hypothetical protein  30 
 
 
494 aa  109  9.000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1184  hypothetical protein  42.35 
 
 
541 aa  64.7  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.984742 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3599  hypothetical protein  35.07 
 
 
460 aa  62  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.792051  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2704  hypothetical protein  36.07 
 
 
487 aa  57.4  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.788848  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1027  hypothetical protein  30.77 
 
 
231 aa  54.3  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1775  hypothetical protein  37.76 
 
 
304 aa  52  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0870  putative lipoprotein  37.65 
 
 
299 aa  47.8  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000878798  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1123  hypothetical protein  35.29 
 
 
551 aa  47  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.375546  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02737  hypothetical protein  26.63 
 
 
326 aa  46.6  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5946  hypothetical protein  30.61 
 
 
578 aa  46.6  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>