21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3391 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0855  hypothetical protein  83.7 
 
 		 546 aa  940    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3391  hypothetical protein  100 
 
 		 534 aa  1097    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000869188  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0032  hypothetical protein  44.32 
 
 		 496 aa  352  8.999999999999999e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0534564  normal  0.101968 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0489  hypothetical protein  36.03 
 
 		 510 aa  208  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0522  hypothetical protein  34.72 
 
 		 517 aa  202  9e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0517  hypothetical protein  34.72 
 
 		 517 aa  202  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.269944  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3081  hypothetical protein  34.89 
 
 		 524 aa  189  7e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3575  hypothetical protein  31.71 
 
 		 522 aa  171  3e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.774186  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3491  hypothetical protein  31.22 
 
 		 529 aa  171  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3644  hypothetical protein  30.73 
 
 		 523 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2056  hypothetical protein  24.93 
 
 		 449 aa  99.4  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1790  hypothetical protein  33.56 
 
 		 494 aa  84  0.000000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3599  hypothetical protein  32.43 
 
 		 460 aa  57.4  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.792051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1184  hypothetical protein  34.78 
 
 		 541 aa  57.4  0.0000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.984742 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1027  hypothetical protein  38.2 
 
 		 231 aa  56.6  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2704  hypothetical protein  38.64 
 
 		 487 aa  53.9  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.788848  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0870  putative lipoprotein  26.55 
 
 		 299 aa  48.1  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000878798  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1775  hypothetical protein  34.62 
 
 		 304 aa  47.4  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1123  hypothetical protein  27.27 
 
 		 551 aa  47  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.375546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003105  ubiquitin-protein ligase  29.82 
 
 		 326 aa  45.4  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000640015  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02737  hypothetical protein  27.43 
 
 		 326 aa  44.7  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>