16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003105 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003105  ubiquitin-protein ligase  100 
 
 		 326 aa  682    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000640015  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02737  hypothetical protein  83.74 
 
 		 326 aa  586  1e-166  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0870  putative lipoprotein  66.11 
 
 		 299 aa  414  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000878798  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1775  hypothetical protein  58.88 
 
 		 304 aa  371  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2704  hypothetical protein  45.18 
 
 		 487 aa  182  6e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.788848  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3599  hypothetical protein  54.09 
 
 		 460 aa  181  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.792051  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1027  hypothetical protein  33.16 
 
 		 231 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1790  hypothetical protein  35.2 
 
 		 494 aa  55.5  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2056  hypothetical protein  30.33 
 
 		 449 aa  50.1  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0855  hypothetical protein  26.42 
 
 		 546 aa  48.5  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2476  hypothetical protein  26.49 
 
 		 232 aa  48.5  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.324767 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1184  hypothetical protein  27.63 
 
 		 541 aa  45.4  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.984742 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3391  hypothetical protein  29.82 
 
 		 534 aa  45.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000869188  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0489  hypothetical protein  35.96 
 
 		 510 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0522  hypothetical protein  38.96 
 
 		 517 aa  42.7  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0517  hypothetical protein  38.96 
 
 		 517 aa  42.7  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.269944  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>