19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02737 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02737  hypothetical protein  100 
 
 
326 aa  677    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003105  ubiquitin-protein ligase  83.74 
 
 
326 aa  586  1e-166  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000640015  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0870  putative lipoprotein  66.11 
 
 
299 aa  411  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000878798  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1775  hypothetical protein  60.59 
 
 
304 aa  371  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3599  hypothetical protein  54.72 
 
 
460 aa  181  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.792051  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2704  hypothetical protein  48.04 
 
 
487 aa  181  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.788848  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1027  hypothetical protein  43.38 
 
 
231 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1790  hypothetical protein  35 
 
 
494 aa  52.4  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2056  hypothetical protein  29.51 
 
 
449 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2476  hypothetical protein  24.28 
 
 
232 aa  47.4  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.324767 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0855  hypothetical protein  27.52 
 
 
546 aa  47  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0522  hypothetical protein  33.05 
 
 
517 aa  46.2  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0517  hypothetical protein  33.05 
 
 
517 aa  46.2  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.269944  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1184  hypothetical protein  30.52 
 
 
541 aa  45.4  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.984742 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3391  hypothetical protein  27.43 
 
 
534 aa  44.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000869188  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0489  hypothetical protein  33.64 
 
 
510 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3644  hypothetical protein  32.2 
 
 
523 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3081  hypothetical protein  38.71 
 
 
524 aa  42.4  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3575  hypothetical protein  33.05 
 
 
522 aa  42.4  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.774186  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>