26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0365 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0365  OmpA domain-containing protein  100 
 
 		 181 aa  366  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0769021  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0366  OmpA/MotB domain-containing protein  58.86 
 
 		 359 aa  198  3.9999999999999996e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193162  normal  0.220878 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  36.97 
 
 		 420 aa  92.8  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  31.07 
 
 		 457 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  31.82 
 
 		 427 aa  75.1  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1657  opacity protein/surface antigen  29.95 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.92077e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  29.65 
 
 		 401 aa  69.7  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  31.87 
 
 		 466 aa  65.5  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  29.05 
 
 		 468 aa  64.3  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3037  OmpA/MotB domain protein  29.41 
 
 		 432 aa  63.2  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  29.83 
 
 		 459 aa  60.5  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  30.91 
 
 		 459 aa  59.3  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  28.48 
 
 		 381 aa  58.2  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  28.89 
 
 		 466 aa  57.8  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1240  OmpA/MotB domain protein  29.93 
 
 		 434 aa  57.4  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000641372  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0689  OmpA/MotB domain protein  30.16 
 
 		 443 aa  53.9  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000828786  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  28.38 
 
 		 429 aa  52  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  27.55 
 
 		 417 aa  50.8  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  32.68 
 
 		 415 aa  47  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  27.44 
 
 		 454 aa  46.2  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1132  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 450 aa  45.4  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000365045  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3599  hypothetical protein  28.42 
 
 		 460 aa  44.3  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.792051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  26.55 
 
 		 447 aa  42.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0690  OmpA/MotB domain-containing protein  28.47 
 
 		 331 aa  42.4  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  24.31 
 
 		 388 aa  42.4  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3164  OmpA/MotB domain protein  27.33 
 
 		 486 aa  42  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>